Иноки, видя столь великую любовь воеводы к Афанасию, просили его исходатайствовать у Льва милость, чтобы он создал им в Карейской лавре новую, просторную церковь, так как старая была мала и не вмещала всей братии. Афанасий передал эту просьбу, и христолюбивый воевода в тот же час дал ему множество золота и серебра для церковных дел и, простившись с Афанасием и прочими отцами, продолжал свой путь к Царьграду, где рассказал своему брату Никифору о свидании с Афанасием.
С тех пор все отцы Афонские стали почитать и превозносить прп. Афанасия и часто посещали его ради пользы душевной. Он же, любя безмолвие и избегая человеческой славы, удалился из тех мест и обходил внутренние пустыни Святой Горы. Наставляемый Богом, он пришел на самый край Афона, на место, называемое «Мелана», весьма пустынное и отстоящее далеко от других жилищ иноческих. На холме, на самом верху, он поставил себе небольшой шалаш и стал искать высших подвигов. Сперва коварный враг диавол, желая изгнать оттуда преподобного, всячески досаждал ему, боролся с ним помыслами и сильно смущал его, чтобы он уходил от этого места. Но добрый подвижник восставал против помыслов, внушаемых демоном, говоря: «Претерплю я здесь этот год, а по окончании года сделаю, что повелит Господь». Когда же истек год и в последний день нашло на Афанасия от диавола множество помыслов, он стал говорить себе: «Утром выйду отсюда и перейду в Карейскую лавру».
Афанасий стал на молитву, совершая пение третьего часа. Внезапно осиял его свет небесный, и, как облако, рассеялись помыслы его. Он исполнился невыразимого веселья и радости, услаждаясь божественным желанием в своем сердце и источая слезы из очей.
С тех пор преподобный Афанасий получил дар умиления и плакал, когда только хотел. Место же то настолько возлюбил, сколь раньше оно было ему ненавистно, и жил на нем, славя Бога.
В то время Никифор-воевода был послан царем с войском на Крит, которым тогда владели арабы. Но надеясь на силу греческих солдат и ища молитвенной помощи от святых отцов, он послал верного человека кораблем на Афон, написав ко всему собору Афонских отцов, прося их помолиться за него Богу, чтобы ему была подана свыше помощь на арабов. Еще же просил их, чтобы они послали к нему Афанасия, о пребывании которого на Афоне он слыхал от брата своего Льва.
Прочтя послание воеводы, Афонские отцы стали прилежно молиться за него, потом разыскали Афанасия в пустыне, позвали к собору и велели отправиться к воеводе. Афанасий сперва кротко отказывался, но затем, принуждаемый запрещением святых отцов, с трудом повиновался. Послали отцы с ним и одного честного старца, которому Афанасий повиновался, как ученик. Сев на корабль, они отправились на Крит.
Когда они явились к благочестивому воеводе Никифору и тот увидал Афанасия, то побежал к нему навстречу, пал на грудь его и, лобзая его, плакал от радости и оказал ему честь, как духовному отцу своему. Когда же он увидел, что Афанасий представляется перед старцем учеником, он был удивлен его смирением. Ради Афанасия он оставил внешние дела управления и занимался духовной беседой с ним.
Он желал исполнить свое обещание об отвержении мира и об иноческом сане и молил преподобного, чтобы тот построил ему келью в пустыне, в которой сам бы и жил, и предложил ему золота и серебра на постройку этой кельи. Старец же Афанасий, любя безмолвное житие, отклонил заботу его о келье, не принял золота и серебра, чем сильно опечалил воеводу. Несколько дней провели они вместе и наслаждались взаимным лицезрением и беседой, а затем расстались.