Карл остро нуждался в средствах – ему необходимо было собрать немалую сумму чтобы выкупить попавших к англичанам в плен сеньоров. В 1357 году он вынужден был принять в обмен на выделяемые средства условия Генеральных Штатов, практически навязывавших ему конституционную, если не парламентскую, монархию. Однако денег было все равно недостаточно, и Карл дал распоряжение об увеличении налогов. Это решение, естественно, спровоцировало возмущение крестьян и прочих налогоплательщиков – граждан Франции.

В январе 1358 – марте 1359 года король Иоанн подписал Лондонские соглашения, которые предусматривали его возвращение во Францию в обмен на столь тяжелые условия, что дофин Карл отказался их принять, после чего Эдуард III стал называть себя «королем Англии и Франции». Не удивительно, что подобное «перемирие» между англичанами и французами не принесло спокойствия стране. Более того, многие деревни подверглись разграблению со стороны английских отрядов, бесчинствовавших по всей Франции. Препятствовать им французы не могли, являясь проигравшей стороной, заключившей мир на невыгодных для себя условиях. Это стало очередным ударом для крестьянства, которое не успело еще оправиться от удара, нанесенного эпидемией чумы конца 1340-х годов.

Все эти события привели к тому, что в 1358 году по Франции прокатилась волна крестьянских восстаний, получивших в истории название Жакерия по прозвищу Жак-Простак, которым французские дворяне окрестили крестьян.

Восстание началось в мае 1358 года на северо-западе Франции и быстро распространилось в Пикардии, Шампани, Иль-де-Франсе и других областях. Стихийно сформировалась крестьянская армия, состоявшая из 5 – 6 тысяч человек. Восставшие громили замки и убивали их обитателей. В восстании предводительствовал Гийом Каль, который предпринял попытку объединиться с восставшими в Париже горожанами.

Восставшими парижанами предводительствовал Этьен Марсель. Это восстание было также вызвано недовольством налоговым бременем. Дофин Карл был вынужден бежать из бунтующего Парижа, а Этьен Марсель попытался воспользоваться его бегством и отсутствием короля и сместить неугодных торговому сословию административных чиновников.

Бежав из восставшего Парижа, Карл, слабый здоровьем кабинетный ученый, снова, как и в битве при Пуатье, проявил неожиданную храбрость и энергию, объединившись со знатью Пикардии и Артуа и добившись субсидий от собрания сословий Шампани. В то же время Этьен Марсель отослал в поддержку участникам Жакерии отряд из 300 человек с целью организовать борьбу с войсками дофина, блокировавшего Париж. Дворяне, застигнутые восстанием врасплох и поначалу растерявшиеся, стали объединяться вокруг Карла II Наваррского (Карла Злого). Восставшие заняли позиции близ деревни Мело, но на равнинной местности, где они расположились, рыцарская конница была особенно опасна. Гийом Каль с несколькими соратниками прибыл в лагерь Карла Злого для переговоров, где и был схвачен и казнен. В результате 10 июня 1358 года лишенные руководства и слабо вооруженные мятежные крестьяне были разгромлены дворянами во главе с графом де Гастоном де Фуа и Жаном III де Граили. Как принято в истории, за подавлением восстания последовали массовые репрессии его участников.

В августе 1358 года Карл триумфально вернулся в Париж, решительно настояв на прерогативах королевской власти.

8 мая 1360 года англичане и французы, которых на этот раз представлял Карл, заключили новые соглашения в Бретиньи, менее позорные, чем те, на которые ранее согласился в Англии его отец. Возвращение королю Иоанну его титула и свобода его и его свиты были достигнуты ценой потери почти половины королевства и выплаты выкупа в 3 миллиона золотых экю. Кроме того, место короля в качестве заложников должны были занять его брат Филипп Орлеанский и двое его сыновей.