После полудня толпа у горкома была рассеяна: по официальной версии – предупредительными выстрелами в воздух; по более распространенной версии, но открыто не поддерживаемой властями, – огнем на поражение. В это же время толпа пыталась вновь осадить ГОВД, но была быстро отбита. Митингующим удалось захватить железнодорожный вокзал, а на путях – состав с горючим. Из одной цистерны было слито топливо, его грозили поджечь и взорвать цистерны, если не будут выполнены требования. Также были заняты Новококандский химзавод, масложировой комбинат и другие предприятия (всего 12 объектов). Все они через короткое время, в том числе и железнодорожный вокзал с составами, были отбиты маневренными группами и спецназом ВВ. На окраинах города продолжались грабежи и поджоги домов, принадлежавших туркам, попутно было сожжено и несколько домов местных сотрудников милиции. Была совершена попытка нападения на автобазу, где накануне укрыли турок, но она была пресечена. Большинство турок вывезли из города накануне, оставшихся 60 человек эвакуировали несколькими вертолетными рейсами.

Днем стихийный митинг собрался в Риштане (районный центр, расположенный между Ферганой и Кокандом). В нем участвовало, по разным оценкам, от 2 до 3 тысяч человек.

8 июня в Яйпане толпа осадила здание РОВД, пытаясь захватить оружие и отпустить задержанных. Одновременно было совершено нападение на здание районной прокуратуры. Толпа была рассеяна только после вмешательства внутренних войск, срочно переброшенных сюда вертолетами. Как и в других случаях, солдаты были вынуждены применять оружие на поражение. Днем и вечером по области передвигались на захваченных машинах группы погромщиков.

9.06.1989. В ночь с 8 на 9 июня в поселке Горский были разграблены и сожжены два дома, хозяин одного из них – Юнус Османов – сожжен заживо. Вечером 9 июня в Горском собралась большая толпа местных узбеков, вооруженных топорами и вилами, якобы для обороны от турок, решивших отомстить за погром. Толпа рассеялась после прибытия маневренной группы внутренних войск.

Днем, приблизительно в 13:00, около 2 тысяч человек на машинах, двигавшихся колонной из Кировского района в Коканд, были остановлены мобильной группой ВВ на подступах к городу. Была предпринята повторная попытка захвата РОВД Узбекистанского района, при этом стену здания таранили грузовиком. Был взят в заложники председатель райисполкома (освобожден группой спецназа ВВ). Нападавшие также подожгли здание прокуратуры.

В Бешарыке толпа также безуспешно пыталась захватить здание РОВД. К вечеру 9 июня в Кокандской зоне в целом наступила стабилизация. На военном полигоне около Ферганы собрано приблизительно 15 тысяч турок. В тот же день началась эвакуация в Россию, в первую очередь больных и детей.

10.06.1989. За сутки в области произошло, по сообщению коменданта, 16 погромов и поджогов, сожжено 7 жилых домов. В беспорядках участвовали уже только малочисленные группы. По другим источникам, 10 июня продолжались попытки прорыва толп погромщиков в Коканд и их столкновения с войсками. В ночь на 10 июня на выезде из Коканда четверо с ножами набросились на постового ГАИ, их задержали солдаты ВВ.

10 июня во второй половине дня была совершена попытка нападения на временный лагерь в Аштском районе Ленинабадской области Таджикистана, где укрывались эвакуированные турки. Турки из Коканда в ночь с 7 на 8 июня были доставлены в Канибадам (Ленинабадская область Таджикистана), 8 июня перевезены в поселок Навгаразан, подчиненный Кайраккумскому горсовету. В тот же день в прилежащем Аштском районе появились посланцы из Коканда, требовавшие от местных жителей изгнать турок. В сторону Навгарзана двинулась толпа в полторы тысячи человек, вооруженных холодным оружием.