Позже, в период Перестройки, он, как уже отмечалось, возглавил сектор политологических исследований, формируя тем самым поле политических исследований в рамках ведущего в стране академического юридического института. Начиная с средины 1990-х гг., уже в новой России, он выполнял и важнейшую экспертную функцию, активно участвуя в деятельности Комиссии по правам человека при Президенте РФ в рамках «академического периода» ее работы под руководством доктора юридических наук В. А. Карташкина, а затем помогая Э. А. Памфиловой развивать опыт Комиссии по правам человека уже в рамках Совета по развитию гражданского общества и правам человека[29]. Если к этому добавить деятельность В. В. Смирнова в качестве члена, а затем руководителя секции по вопросам международного сотрудничества Научно-методического совета при Центральной избирательной комиссии Российской Федерации, то мы можем оценить весь объем его гражданско-ориентированной экспертной деятельности, которая также помогала ему выходить за узкие рамках чисто юридического подхода, понимать не только правовую, но и политическую основу реальной политической деятельности, которая включает в себя подготовку и реализацию как собственно политических (в смысле politics), так и политико-управленческих (в смысле policy) решений.

Я познакомился с В. В. Смирновым во второй половине 1990-х гг., когда после моей стажировки в Институте имени Дж. Кеннана начал активно участвовать в работе сообщества выпускников исследовательских программ этого важного научного центра. Вильям Смирнов, продолжая международное направление своей научно-общественной деятельности, также участвовал в этих встречах. Мы с ним сразу нашли общий язык и вскоре подружились. С одной стороны, он активно участвовал в подготовке различных реформ, включая и реформу в области государственного строительства, концепция которой разрабатывалась в 1997–1998 гг.[30] и о которой он упоминал в общих чертах в наших беседах. Сама тема серьезных реформ в этом направлении была мне очень близка. Однако, будучи связанным соглашением о конфиденциальности, он не вдавался в суть предложений рабочей группы, которые так и остались предложениями, поскольку окно возможностей для ее проведения закрылось[31].

Наше сотрудничество с В. В. Смирновым стало более конкретным, когда в 2002–2003 гг. я как председатель экспертного совета по гражданскому образованию и образованию в области прав человека при председателе комитета по науке и образованию Государственной Думы, которым был тогда мой давний друг и соратник А. В. Шишлов, инициировал работу по подготовке Федеральной программы в этом направлении. Вильям вошел в рабочую группу по подготовке данной программы, а далее, когда на выборах декабря 2003 г., А. В. Шишлов не прошел в депутаты, предложил мне продолжить эту же деятельность уже в рамках Совета при Президенте РФ по развитию гражданского общества и правам человека, ответственным секретарем которого он был и членом которого я стал в ноябре 2004 г.[32]

Наш взаимный интерес к теме образования в области прав человека как важной части гражданского образования как такового привел нас с В. В. Смирновым к совместному участию в семинаре по гражданскому образованию, который проводился Российским отделением международной организации «Civitas» летом 2004 г. в поселке Ольгино под Санкт-Петербургом. Участниками и лекторами семинара были также О. Ю. Малинова, которая в это время, так же как и В. В. Смирнов, была вице-президентом РАПН, и известный российский правозащитник В. М. Гефтер. В ходе семинара и совместных прогулок по Финскому заливу, в частности, родилась идея создания в рамках РАПН нового исследовательского комитета по правам человека. Эта идея далее нашла практическое воплощение, и такой Исследовательский комитета был создан. Таким образом, тема прав человека получила научно-общественное закрепление в российской политической науке. Соответственно, на всех ежегодных конференция РАПН, а также на политологических конгрессах, которые РАПН организует каждые три года, проходили секции, организованные нашим исследовательским комитетом, и В. В. Смирнов всегда был их активным участником и организатором