Параллельно с расследованием Комиссии Тауэра по делу «Иран-контрас» проводились независимые расследования, результаты которых публиковались в СМИ. Так, журналисты американской газеты Miami Herald установили, что личный состав подразделения ВВС США Оперативной группы 160 из состава 16-й вертолетной эскадрильи сил специальных операций ВВС США (16th Special Operations Squadron) участвовал в выполнении как минимум восьми операций на территории Никарагуа и по меньшей мере дважды открывал огонь по подразделениям Сандинистской народной армии. А корреспонденты газетного треста Knight Ridder нашли родственников двух погибших пилотов из Оперативной группы 160. Отец погибшего в марте 1983 года пилота Дональда Олни сообщил, что его сын рассказывал ему о том, что выполняет полеты в Никарагуа с территории Гондураса, а вдова погибшего унтер-офицера Аллена Дженнингса сообщила, что ее муж рассказал, что военное командование направляет его на выполнение специального задания за границей. В ходе расследования обстоятельств гибели Д. Олни и А. Дженнингса журналисты газеты Тhe Philadelphia Inquirer установили, что обстоятельства гибели личного состава 16-й вертолетной эскадрильи сил специальных операций ВВС США были засекречены и не поступали в исследовательский центр безопасности полетов армии США в штате Алабама.

8 декабря 1986 года, рассуждая о последствиях скандала «Иран-контрас», Хантер Томпсон написал в своей колонке в The Sun Francisco Examiner: «В этом столетии республиканцам больше не удастся победить на крупных выборах. Рональд Рейган выполнил свое предназначение, и теперь ему остается одиноко бродить в рубище. Теперь он похож на короля Лира – нищий, дряхлый и презираемый старик». Прогноз этот, как известно, не оправдался: после окончания второго срока президентства Рональда Рейгана на выборах победил Джордж Буш-старший, вице-президент в рейгановской администрации. Но тогда, в конце 1986 года, очень многие наблюдатели ожидали импичмента Рейгану и прихода к власти демократов. Тем не менее скандал «Иран – Контрас» дал лишний аргумент тем, кто, вслед за тем же Томпсоном, утверждал: «Начиная с Улисса Гранта и кончая Большим Биллом Маккинли и Уорреном Гардингом, все президенты-республиканцы были настолько грязными, что не могли спать по ночам».

Скандал «Иран-контрас» имеет глубокие исторические корни. По большому счету, все началось с того, что в феврале 1979 года в Иране победила Исламская революция. Шах Мохаммед Реза Пехлеви вынужден был бежать из страны. 22 октября 1979 года шах прибыл в США для проведения операции по поводу рака. Ранним утром 4 ноября несколько сотен молодых иранцев, назвавшихся студентами, вдохновленные речами аятоллы Хомейни о «Великом Сатане» – Америке, ворвались в американское посольство в Тегеране. Из 59 сотрудников посольства шестеро смогли сбежать и скрыться в посольствах других западных стран, а позже по подложным документам покинуть Иран. Еще один был отпущен в июле 1980 года по состоянию здоровья. Остальные оставались в заложниках 444 дня.

Аятолла Хомейни назвал американское посольство «шпионским гнездом», а его захват – «новой революцией». Кризис с заложниками и неудачная операция американского спецназа по их освобождению, в которой погибло восемь военнослужащих, стал главной причиной поражения президента-демократа Джимми Картера на президентских выборах 1980 года, на которых победил Рональд Рейган.

Заложники были освобождены 20 января 1981 года, в день инаугурации Рейгана, в соответствии с подписанными днем ранее при посредничестве Алжира соглашениями. США отказались от вмешательства во внутренние дела Ирана, разморозили иранские банковские счета, сняли торговые санкции и получили гарантии выплат по долгам Ирана. Но дипломатические отношения между США и Ираном так и не были восстановлены. Поэтому для организации поставок оружия в Иран администрации Рейгана пришлось прибегать к услугам ЦРУ.