С начала Великой Отечественной войны жизнь института изменилась. В июле 1941 г. был организован учебный 10-й истребительный батальон, вошедший затем в состав 20-й стрелковой дивизии, организован и переправлен через линию фронта партизанский отряд из студентов ЛИИЖТа. В сентябре начали действовать команды МПВО, укомплектованные из преподавателей, студентов, рабочих и служащих. В первые же месяцы войны в институте организовали Оборонную комиссию под председательством М. М. Панфилова, в которую вошли крупнейшие ученые института. Осенью 1941 г. учебу в институте начали всего 270 студентов. В декабре 1941 г. выпущено 355, в начале 1942 г. – еще 211 специалистов. В феврале 1942 г. институт эвакуировали в Новосибирск. С эшелоном выехало 7 преподавателей и сотрудников и 386 студентов. В апреле 1942 г. после вывоза коллектива в Новосибирск М. М. Панфилов приказом наркома путей сообщения был освобожден от должности начальника института и назначен начальником Управления учебных заведений НКПС. С 1945 по 1963 г. работал начальником Ростовского института инженеров железнодорожного транспорта. Умер М. М. Панфилов в 1963 г., похоронен в Ростове.

Н. И. Яроменок (1916–1941) – участник Великой Отечественной войны, сержант, стрелок 38-го запасного стрелкового полка. Умер 24 декабря 1941 г. в плену в Шталаге IB, Хоенштайн, Литва[128].

Жилой дом служащих института, хотя и имеет нумерацию по Московскому проспекту, с проспекта не виден. Его закрывает выстроенный в 1956 г. полукруглый выходящий на Фонтанку корпус. Некогда похожий на тюрьму, шестиэтажный домище на углу Фонтанки (дом № 113) и Московского проспекта (дом № 9) возведен в 1926 г. Он – один из немногих сохранившихся в Петербурге домов-коммун. Идея домов-коммун родилась в первые годы Советской власти. Дом-коммуна мыслился как «социализм в одном здании». Эти дома считались реальным воплощением идеи об отмирании семьи и социалистического переустройства быта. В мечтах новых идеологов дома-коммуны – это огромные здания на пять-шесть тысяч человек с комнатно-коридорной системой. На каждом этаже – общая кухня, библиотека, комната отдыха, механическая прачечная. Однако таких домов было построено всего несколько, а сохранились единицы.

Среди таких сохранившихся – общежитие СПГУПС, увидеть его можно, зайдя во двор университета. Строительству предшествовали снос оказавшегося в пятне застройки изящного трёхэтажного домика начала XIX в. с его немудреными «службами», и расчистка всей территории. Перед заселением дом увенчали гипсовым знаком его принадлежности жилищному товариществу (такие знаки ещё встречаются на домах в центре города). В 1949 г. дом-комунну начали расселять, и после ремонта в нём устроили институтское общежитие.

Об этом доме рассказала бывшая его жительница, Татьяна Евгеньевна Месрадыкова, опираясь не только на собственные детские воспоминания, но и на рассказы своей матери, жившей в доме с 1928 по 1949 г.

«По соседству с дворцом Юсуповых, во дворе Железнодорожного института, что на углу Московского и Фонтанки, построили „коммунистический дом“. Дело было в 1926 г., когда быт унижал женщину, семья становилась пережитком прошлого, а интересы нового человека – общими и возвышенными. На каждом этаже был длинный коридор буквой „П“. Направо и налево – двери в комнаты, где проживали чуждые мещанству строители нового общества. В ножках буквы „П“ располагались массовые коммунальные удобства: 2 умывалки (мужская и женская), о шести кранах каждая, и 4 одноместных туалета. В этих же ножках, а также в углах изгибов огромные помещения были отведены под „рекреации“. Предполагалось, что избавленные от унизительного быта коммунальщики будут проводить там культурный досуг, беседуя, читая вслух и слушая музыку.