Оскудение дворянства вынудило казну сделать серьезные уступки военному сословию. Налоговые льготы касались только мелкопоместных дворян, составлявших ядро русской армии, и они должны были приостановить их разорение.

Высшим судебным органом государства был царский суд. Обращаться к царю, минуя низшие судебные инстанции, запрещалось. Виновные в нарушении этого положения наказывались. Царский суд и Расправная палата при Боярской думе разбирали дела только лиц из высшего сословия.

Были созданы специальные приказы: Земский, Разбойный, Сыскной, Холопий и Поместный. Приказные казначеи фактически держали в своих руках развитие московского законодательства, поскольку именно они формулировали и редактировали тексты законов на основе норм царского «приговора».

Судебными правами обладали губные и земские избы и воеводы. Волостные крестьяне избирали из своей среды судеек, которые разбирали незначительные иски по гражданским делам.

Вотчинные суды осуществляли суд над крепостными крестьянами по гражданским и мелким уголовным делам.

В Судебнике 1550 года было зафиксировано требование об участии при судебных разбирательствах «судных мужей», которые были призваны контролировать судебные решения.

К церковным судам относились суд митрополита, а с 1589 года – суды патриарха и патриарших приказов, на местах – суды архиереев и десятильников.

Из многочисленных правовых источников второй половины XVI века наиболее важными являются следующие: Судебник 1550 года, Стоглав 1551 года, приговоры Боярской думы, постановления Земских соборов, указные книги Земского, Поместного, Разбойного, Холопьего и других приказов, Медынский губной наказ 1555 года, духовные грамоты и указы. В 1589 году был составлен «Судебник царя Федора Ивановича» и «Сводный судебник». Оба они не были официально утверждены царским правительством, но на практике применялись.

Судебник 1550 года конкретизировал общую схему законодательного процесса в Русском государстве второй половины XVI века. Он ограничил власть наместников, отменил податные льготы монастырей, расширил круг вопросов, регулируемых центральной властью, и прежде всего уголовно-правовые и имущественные отношения. В Судебнике расширен круг субъектов преступления за счет присоединения к ним холопов. Были выделены «лихие» преступления. К ним относились разбой, грабеж, поджог, убийство (душегубство). Закон различал простое и квалифицированное убийства. В центре стояла охрана жизни, принадлежащей Богу, поэтому за душегубство разбойники карались смертью.

Появилось здесь понятие «крамола», были выделены государственные преступления: заговоры и мятежи. К этой группе преступлений были отнесены преступления против порядка управления и суда, а также казнокрадство. Взяточничество рассматривалось как уголовно наказуемое деяние. Ответственность за должностные преступления имела сословный характер: высшее боярство выплачивало штрафы, дьяков наказывали тюрьмой, подьячих – торговой казнью. Преступления против личности и собственности в Судебнике в большинстве случаев объединены (татьба, разбой, грабеж). Смертной казнью могла наказываться церковная и «головная» татьба. За обычную кражу били кнутом, заставляли возместить ущерб и сажали в тюрьму до тех пор, пока виновного не брали на «крепкие поруки». При вторичной краже и разбое тщательно расследовалась связь с «лихими людьми» – при обнаружении ее могла следовать смертная казнь. Была введена смертная казнь за ябедничество (злостную клевету) и сговор в антигосударственных преступлениях. Предусматривались санкции за финансовые злоупотребления. Возникла необходимость в регламентации торговых пошлин, охране торговли. По всем торгам были разосланы единые меры для торговли. Употребление старых влекло возникновение уголовной ответственности: сначала штраф, а потом тюремное заключение. В 1553 году в Москве состоялась массовая казнь преступной организации, занимавшейся подделкой монет.