Но злая судьба не перестает преследовать Черского: посланные в Москву коллекции не привлекли внимания специалистов, его ходатайство перед петербургским начальством с просьбой разрешить учиться в Казанском университете возвратилось с безжалостно категорическим «Отказать», а тут еще страшная болезнь, свалившая с ног, после чего Черского «списывают» из штрафного батальона как непригодного к военной службе. Было отчего прийти в отчаяние!

В эту-то очередную полосу невезений к нему на помощь снова пришел А. Л. Чекановский, ставший к тому времени одним из видных исследователей геологии Восточной Сибири. По его рекомендации Черского перевели «под надзор» в Иркутск, и он занял сразу три должности при Сибирском отделе Географического общества – библиотекаря, консерватора музея и даже писаря! Его, однако, более всего привлекает обработка коллекций костей древних животных, собранных в музее. Первые же месяцы работы в Иркутске Черский составил каталог ископаемых.

Не удивительно поэтому, что когда в один из осенних дней 1871 года рабочие при копке фундамента под военный госпиталь, который строился на правом берегу речушки Ушаковки, наткнулись на скопление костей вымерших животных, то они через члена отдела В. А. Бельцова сразу же попали в руки А. Л. Чекановского и И. Д. Черского. При ближайшем рассмотрении находок выяснилось потрясающее по неожиданности обстоятельство: землекопы и В. А. Бельцов собрали в буроватой лессовидной глине не просто очередную палеонтологическую коллекцию много тысячелетий назад умерших и захороненных в земле животных, а остатки пищи человека каменного века! Вместе с раздробленными костями первобытного быка, северного оленя и дикой лошади были обнаружены грубо расколотые камни и вырезанные из слоновой кости «вещи строго определенных форм». Необычайно значительная глубина залегания культурных остатков, кости мамонта, с которыми археологи Западной Европы обычно находили орудия человека древнекаменного века, привели И. Д. Черского и А. Л. Чекановского к выводу о том, что на берегу Ушаковки открыто первое в России палеолитическое поселение человека «эпохи до потопа».

Ввиду исключительной ценности открытия А. Л. Чекановский и И. Д. Черский по соглашению с В. А. Бельцовым решили провести раскопки на месте находок. Речь шла не только о том, чтобы получить дополнительные материалы по культуре, отодвигающие первое появление человека в Сибири по крайней мере на десяток тысячелетий, а прежде всего о бесспорном строго научном подтверждении глубокого возраста поселения первобытных охотников Северной Азии.

Геологические условия залегания слоя с культурными остатками, толщина которого достигала местами 40 см. не оставляли сомнений в значительной древности первобытного лагеря – поверхность земли, по которой ступала нога человека каменного века, перекрывалась двухметровой глинистой толщей. То, что люди поедали здесь животных, более десятка тысяч лет назад подтверждали разновидности жертв охотников: при раскопках были найдены кости давно вымерших видов быков и лошадей. Первобытные люди убивали также благородных оленей, каких-то крупных птиц, собрали раковины наземных моллюсков. На отдельных костях И. Д. Черский выявил следы нарезок, оставленных каменными орудиями при разделке туш животных. Грубость изделий из камня наглядно подтверждала вывод о глубоком возрасте памятника.

По контрасту с каменными и костяными орудиями совершенными и на удивление изящными выглядели лишь предметы искусства и украшения, более всего поразившие руководителей раскопок: из «слоновой кости», «бивней мамонта» были вырезаны покрытые нарезками шары, крупные цилиндрические, с просверленным в центре сквозным отверстием подвески, шлифованные кольца-браслеты, бусы из клыков благородного оленя, «цилиндрические головки» с отчетливо суживающейся шейкой. пластинки из бивня с просверленным отверстием. Мастерство, проявленное первобытным художником при отделке этих вещей. оказалось настолько совершенным, что никто из посетителей раскопа не хотел верить, что они изготовлены каменными орудиями. Тогда Черский, проявив незаурядное терпение, упорство и настойчивость. экспериментально доказал, что примитивными каменными инструментами, найденными около Военного госпиталя, можно вырезать из бивня мамонта любое из найденных украшений.