Огромная роль в подготовке докторов отводится их научным руководителям. Во-первых, они должны предложить докторантам для исследования актуальные в научном плане проекты и изыскать источники финансирования для этих проектов. Во-вторых, пригласить и получить согласие быть консультантами (хотя бы для грамотного написания статей) известных зарубежных учёных. Следует отметить, что в этом случае докторанты будут иметь возможность провести исследования в лабораториях, в которых работают научные консультанты. В-третьих, помочь докторантам в проведении исследований, в апробации полученных результатов и их публикации. В-четвёртых, найти на всё это достаточное время.

Перечисленное выше будет невозможным без очень сильной мотивации для профессоров и ведущих доцентов быть научными руководителями докторантов. Казахстанских учёных, достаточно хорошо владеющих английским языком, не потерявших вкус к научной работе, можно мотивировать на научное руководство докторантами несколькими способами. Первый – это выделение на научное руководство одним докторантом 12–14 кредит-часов на один учебный год. Иными словами, научное руководство двумя докторантами должно составлять полную годовую учебную нагрузку данного руководителя. Второй – это приоритетное присуждение государственного гранта «Лучший преподаватель вуза» учёным, сумевшим за три года довести до защиты одного докторанта по предложенной выше схеме. Причём оба способа мотивации должны применяться совместно и последовательно. В научных организациях руководители докторантов будут сами вовлечены в реализацию проекта, поэтому получат мотивацию к получению новых знаний и их обнародованию.

Первую реальную аттестацию докторанта можно провести только после двух лет подготовки. К этому сроку должна быть опубликована первая работа докторанта. Если будет публикация, то подготовку можно продолжить, а если нет публикации – прекращать и запретить научному руководителю подготовку докторантов в будущем. Сразу надо оговорить, что применение санкций к докторантам и их научным руководителям в виде возврата затраченных финансовых средств через суд и прочее недопустимо. Лицо (правительство, компания, фонд), выделяющее деньги на научный проект, идёт на определённый риск. Потому что научное исследование не всегда приводит к результату, имеющему новизну и научно-практическую ценность. Исследования по проекту докторанту или его научному руководителю можно будет, конечно, продолжить и довести работу до защиты, но полностью за свой счёт и/или за счёт иных грантов и в свободное от основной работы время.

Предлагаемая схема подготовки докторантов потребует от них и их научных руководителей напряжённого труда в течение трёх и более лет. Однако этот труд окупится сторицей, так как в случае успеха будут получены действительно новые знания, которые станут достоянием мировой науки.

Самыми критичными в предлагаемой схеме подготовки докторов являются три момента: подготовка проекта на актуальную тематику, изыскание источника финансирования этого проекта и публикация результатов исследований по выбранной проблематике.

В настоящее время для казахстанских учёных публикация результатов научных исследований по естественным и техническим наукам в журналах с высоким импакт-фактором, пожалуй, не меньшая проблема, чем получение новых знаний. Казахстану, возможно, следует создать несколько журналов мирового уровня на английском языке или переведённых на английский язык, в которых в качестве редакторов и рецензентов работали бы известные зарубежные учёные. Может быть, импакт-факторы журналов «Доклады НАН РК», «Известия НАН РК» или одного-двух университетских журналов необходимо поднять до мирового уровня.