Саркофаг, из черного мрамора (по другим данным, из гранита), с гладкой поверхностью, находился над средней частью захоронения. На верхней грани саркофага было вырезано: «Здесь погребено тело Николая Васильевича ГОГОЛЯ. Родился 19 марта 1809, скончался 21 февраля 1852». На боковых наклонных гранях помещались цитаты из Библии. Одной из них, как нельзя лучше, выражалась жизнь покойного: «Горьким словом моим посмеюся. Иеремия, глава 20, статья 8».

Весной 1903 года группа лиц обратилась к настоятелю монастыря с просьбой разрешить «привести в благоустроенный вид могилу Н.В. Гоголя, начавшую разрушаться под влиянием времени». Были предложены следующие меры: «1) выравнять покривившийся памятник; 2) отчистить от посторонних надписей лицевую сторону его; 3) позолотить медный крест, и 4) обнести всю могилу железной решеткой». Однако этим лицам в «исправлении могилы» было отказано. На снимках этого времени можно заметить, что в целом могила выглядела удовлетворительно, но было также очевидно, что она требовала некоторой поправки и приведения в более благоустроенный вид. Так, заметен легкий наклон креста к югу. Настоятельной необходимостью была установка на могиле ограды – прежде всего для дистанции с соседними захоронениями (отсутствие ограды уже привело к появлению посторонних памятников почти вплотную к «Голгофе»).

Только в 1909 году перед юбилейными торжествами – к 100-летию со дня рождения Гоголя – была проведена реставрация могилы, тогда же была сооружена и массивная художественная ограда, созданная скульптором Николаем Андреевичем Андреевым. На ней был медальон с портретом Гоголя, сделанный скульптором с его прижизненного портрета. Работу над решеткой Андреев вел одновременно с созданием известного памятника Гоголю, открытому на Пречистенском бульваре в год юбилея писателя. Старые надгробия – «Голгофа» и саркофаг – приобрели правильное вертикальное положение; внутри ограды они были утверждены на толстой бетонной вымостке, был также вызолочен крест. Газета «Московские церковные ведомости», рассказывая о праздновании, отмечала: «Ярко блестел на солнце золоченый намогильный крест, водруженный в каменной глыбе…»

По случаю гоголевских торжеств реконструировали также вход в Дом настоятеля, служивший непосредственным фоном для могилы писателя. Вместо прежних неказистых сеней здесь возникла достаточно широкая пристройка, наверху которой был устроен балкон с застекленной крышей.

Октябрьская революция кардинально поменяла судьбу старейшего московского монастыря. В 1930 году Данилов был закрыт, на территории монастыря устроили приемник для несовершеннолетних правонарушителей, в связи с чем некрополь Данилова монастыря подлежал ликвидации. Лишь несколько самых дорогих русскому сердцу захоронений было решено перенести на новое место, среди них и могилу Гоголя.

31 мая 1931 года состоялось перенесение праха Николая Васильевича на кладбище Новодевичьего монастыря. Срочно была организована комиссия по перезахоронению. Как свидетельствует «Акт об эксгумации Н.В. Гоголя», хранящийся в Центральном государственном архиве литературы и искусства, на этой церемонии среди членов комиссии присутствовали писатели. Один из них фотографировал все происходящее и оставил воспоминания, после чего по Москве сразу же поползли жуткие слухи о том, что Гоголь был похоронен в состоянии летаргического сна. Я не буду сейчас все это повторять, уверен, что вы это хорошо знаете. При вскрытии гроба прах был разорен, мертвый Гоголь был обворован: некоторые брали себе на память куски материи от одежды и даже кости усопшего. Один из писателей не скрывал того, что взял кусочек жилета и использовал его на переплет первого издания «Мертвых душ», которое хранилось в его домашней библиотеке. Все это иначе, как святотатством, назвать нельзя.