За каких-то полтора часа вредителю удалось заразить около 6 тыс. машин. Произошедшее повергло общественность в шок: вирусы гуляли по Сети и ранее, но заразить каждый десятый компьютер до сих пор не удавалось никому. Срочно были пересмотрены требования к безопасности систем и созданы институты вроде CERT (Computer Emergency Response Team – команда по ответам на непредвиденные компьютерные ситуации), которые стали заниматься безопасностью компьютеров и давать рекомендации по устранению вирусов.

Компьютеры становились все доступнее. Со временем большинство платформ и операционных систем унифицировалось, на рынке стали преобладать Intel-совместимые компьютеры, которые работали под управлением операционной системы, разработанной компанией Microsoft. Дальнейшие события развивались с огромной скоростью. В 1991 году появился полиморфный вирус, видоизменявший свое тело. Операционная система Windows 95 была практически готова, и ее beta-версию разослали 160 тестерам. Все диски оказались зараженными загрузочным вирусом Form, и только один тестер не поленился проверить диск антивирусом. В пресс-релизе, посвященном выходу принципиально новой операционной системы, было сказано, что она полностью защищена от вирусов всех типов. Через несколько месяцев эти заявления были разнесены в пух и прах неожиданным подарком – первым макровирусом, представлявшим собой не привычный исполняемый файл, а сценарий, который заражал документы Microsoft Word. В течение месяца макровирус Сoncept облетел вокруг земного шара, внедрился в компьютеры пользователей Microsoft Word и парализовал работу десятков компаний по всему миру.

В январе 1996 года появился первый вирус для операционной системы Windows 95 – Win95.Boza, а резидентный вирус Win95.Punch, появившийся позже, окончательно подорвал доверие пользователей к Windows 95. В марте этого же года началась первая эпидемия вируса Win.Tentacle, написанного для Windows 3.0/3.1. Он заразил компьютерную сеть в нескольких учреждениях Франции. До этого все Windows-вирусы хранились только в коллекциях и электронных журналах вирусописателей, на свободе гуляли лишь написанные для MS-DOS загрузочные и макровирусы. В этом же году был пойман макровирус Laroux, написанный для Microsoft Excel.

В 1997 году на свет появились новые виды вирусов – FTP– и mIRC-черви, в июне 1998 года – вирус Win95.CIH. Этот вирус активизировался 26 апреля (впервые – в 1999 году) и уничтожал информацию на жестком диске, записывая на него мусор. Кроме того, он перезаписывал Flash BIOS, если переключатель находился в положении, разрешающем запись, и выводил из строя материнскую плату.

Червь I love you, выпущенный на Филиппинах в мае 2000 года, нанес владельцам компьютеров ущерб на сумму, по некоторым оценкам превышающую $10 млрд. Следующий червь, вошедший в историю как Code Red, за 14 часов сумел заразить более 300 тыс. компьютеров, подключенных к Интернету. После них были и другие, часто – первые в определенной категории. Например, Nimda (слово admin, прочитанное наоборот), многовекторный червь, распространялся сразу несколькими способами, включая «черные ходы», оставленные другими червями. MyDoom был признан самым быстрым червем, распространяющимся по электронной почте.

До этого большая часть вирусов была написана на языке низкого уровня – ассемблере, позволявшем создать небольшой оптимизированный вирус. Автором червя AnnaKournikova, который поразил Интернет в феврале 2001 года, оказался голландский студент, который вообще не умел программировать, даже на таком простом языке, как Basic.