В конце 1890-х гг. Главный запасный магазин объединился с Инструментальным хирургическим заводом в Завод военноврачебных заготовлений. Впервые в России здесь было налажено массовое производство готовых дозированных лекарственных препаратов. С 1900 г. стала действовать таблеточная мастерская, изготовлявшая прессованные таблетки из дозированных порошков. Выпускались настойки, экстракты, мази, растворы из растительных веществ.

25 мая 1900 г. завод переименован в завод врачебных заготовлений. В его обязанность входило снабжать всем необходимым учреждения, подчиненные Главному военно-санитарному управлению, а затем – Наркомату здравоохранения. На заводе изготовляли весь комплекс медикаментов, необходимых Красной Армии и населению, – хирургические инструменты и врачебные предметы, аппараты для дезинфекции, фельдшерские сумки, протезы, асептические и индивидуальные пакеты, халаты для медицинского персонала.

В 1922 г. завод назывался «Военврач», с 1937 г. – Химикофармацевтический завод № 1. Приказом наркома здравоохранения от 11 сентября 1938 г. завод ориентировался на выпуск готовых медицинских препаратов и патентованных средств. С 1939 г. создавались новые врачебные препараты: цитрамон, таблетки витамина С и сухого йода, свинцовая примочка и другие.

Во время Великой Отечественной войны ни один из цехов завода, несмотря на острую нехватку сырья, топлива, электроэнергии, не был законсервирован. Из 660 рабочих, работавших до войны, в блокаду оставалось лишь 339 человек.

С 1977 г. завод стал головным предприятием производственного химико-фармацевтического объединения «Октябрь». В этот период учеными были разработаны новые препараты, одним из которых стал дактиномицин, рожденный в онкологическом центре. Для его выпуска в ампульном цехе объединения, возглавляемом Т.И. Шишигиной, создали асептическую среду, то есть полностью стерильный участок. В 1978 г. объединение выпустило лечебное средство, которого ждали многие тысячи людей, – валидол в капсулах (впервые в мировой практике). За ним появился нитроглицерин в капсулах. В 1970-е гг. лекарства, выпускавшиеся объединением «Октябрь», направлялись в 24 страны.

В настоящее время предприятие прекратило свое существование. В здании расположились различные офисы. В 2010-е гг. здание предполагается реконструировать под офис-центр. Авторы проекта реконструкции – архитекторы В.Э. Лявданский, О.Ю. Конева, В.А. Мартынова.

В соседнем доме № 7 находилось фармацевтическое и перевязочное производство, принадлежавшее Главному запасному магазину. Здание возведено в 1900-е гг. по проекту военного инженера Л.Г. Малеева.

В 1920-е гг. в нем находилась Окружная химико-бактериологическая лаборатория Ленинградского военного округа. В 1945 г. разместился Механический техникум, который готовил техников широкого профиля. В конце 1960-х гг. его перевели на Песочную набережную, 14. В настоящее время в здании находится библиотека завода «Красногвардеец».

Дома № 9-11 по Аптекарскому проспекту (дома № 3-36 по Инструментальной ул.) возведены в 1843–1844, 1852–1855 гг. по проекту А.М. Горностаева. В них располагались производственные здания и лаборатория завода военно-врачебных заготовлений. В 1900-е гг. здания перестроены по проекту Л.Г. Малеева.

В 1719 г. в целях снабжения русской армии необходимым перевязочным материалом и хирургическими инструментами Петр I повелел «при Главной аптеке в Аптекарском огороде выделывать лекарские инструменты».

С 1721 г. на углу Аптекарского проспекта и нынешней Инструментальной улицы находилась «Мастеровая изба лекарских инструментов», или «инструментальная изба», укомплектовывавшая врачебными инструментами русскую армию, а с 1760 г. и Военно-морской флот. Первым руководителем производства был искусный мастер Василий Шершавин, который принял государственную присягу и руководил производством двадцать лет. «Инструментальная изба» относилась к Медицинской канцелярии. В 1760 г. она переименована в Петербургскую инструментальную фабрику. На базе фабрики хирургических инструментов в 1796 г. вырос Петербургский инструментальный хирургический завод, будущий завод «Красногвардеец» (дом № 9). На нем работали 30 мастеровых – коренных жителей Аптекарской слободы.