В Абукирском сражении французы потеряли 11 линейных кораблей, 2 фрегата и около 3,5 тыс. чел; англичане – 218 убитых и 678 раненых.

В результате морской победы англичан 30 тысячная экспедиционная армия Бонапарта оказалась отрезанной от Европы и закупоренной в Египте. В сентябре 1798 г. Турция объявила войну Франции. В целях предотвратить наступление турецкой армии и в соответствии со стратегическими планами Бонапарт с 13 тысячным отрядом в феврале 1799 г. предпринял поход в Сирию. Овладев Яффой и Хайфой, французские войска 18 марта подошли к крепости Акра, но после двухмесячной осады и неудачного штурма 21 мая вынуждены были отступить и 14 июня возвратиться в Египет. Турецкие войска, оборонявшие Акру, поддерживали английские корабли (два линейных корабля под командованием капитана С. Смита). Положение французской армии было безнадежным. Она уже не могла угрожать англичанам, а о походе в Индию не стоило и мечтать.

Абукир помог английским политикам создать в 1798 г. вторую коалицию против Франции. Установление французского контроля в Голландии и Швейцарии, захват Бонапартом Мальты и его поход в Египет вновь подтолкнул ряд держав к объединению. Разгром французского флота и упрочение английских позиций в Средиземном море содействовали достижению договоренности между Англией, Россией, Австрией, Испанией, Неаполем, Турцией, образовавшими вторую коалицию.

Вторжение французов в Египет, откуда Бонапарт хотел угрожать Индии, затрагивало не только интересы Англии и Турции, но и интересы России, ибо укрепление французов в Египте и в восточной части Средиземного моря грозило превращением Греции во французского вассала, появлением французского флота в Черном море и уничтожением всего того, что было достигнуто Россией в результате двух войн с Турцией.

Упрочение французского влияния в Центральной Европе, захват французами Северной Италии, находившейся под властью Австрии, обусловили участие Австрии в новой войне против Франции. А вторжение французской экспедиционной армии в Египет превратило Турцию в непримиримого врага Франции.

Вступив на престол, Павел I решил поберечь истощенные предыдущими войнами силы России, вернул из Англии эскадру М. К. Макарова и отменил поход А. В. Суворова в Европу. Но не прошло и двух лет, как из опасения, что Франция, перекраивая карту Европы, нападет на русские черноморские владения, правительство Павла I опять было вынуждено принять деятельное участие в войне против Франции. В спешном порядке две эскадры были отправлены в Северное море, а третья – в Средиземное море. Там уже вовсю хозяйничали солдаты Бонапарта: на Занте арестовали нашего консула, на Ионических островах под страхом смерти запретили грекам вступать в какие-либо сношения с Россией, захватили Мальту.

Английский посол в Петербурге привел в движение все пружины при дворе Павла. «Великому магистру» внушили мысль, что захват Мальты Бонапартом – не только угроза всем европейским государям, но и личный оскорбительный вызов ему самому. Павел вступил в союз с Англией и Австрией против Франции.

18/29 декабря 1798 г. в С.-Петербурге был заключен русско-английский союзный договор. Целью его было «…содействовать к остановке дальнейших успехов французского оружия, <…> принудить Францию… возвратиться в границы, которые она имела до революции…»

Россия и Англия имели намерение пригласить короля прусского принять действительное участие в войне против общего врага. Англия брала на себя обязательство уплатить России в случае выступления ее войск для совместных действий с прусскими войсками 225 000 фунтов стерлингов.