В настоящее время в результате поэтапного выполнения программных положений налоговой политики, практически каждый налог содержит в себе элементы стимулирования инновационных процессов, что видно из анализа действующих механизмов существующих налогов.

В 2002 г. в связи с введением 25-й главы НК РФ, налоговая ставка налога на прибыль организаций была снижена до 24 %, но при этом практически все налоговые льготы, в том числе и инвестиционная, которая напрямую связана с инновационными возможностями организаций, были отменены. Вместе с тем говорить, что в ныне действующем законодательстве по налогу на прибыль организаций отсутствуют стимулы для развития инновационного процесса, нельзя, – поменялся механизм воздействия налогового законодательства на стимулы к инновационной деятельности налогоплательщика

Важным шагом в стимулировании инновационной деятельности стало существенное расширение с 2008 г. перечня расходов, учитываемых в целях формирования налоговой базы по налогу на прибыль. В частности, в состав затрат были включены средства целевого финансирования, получаемые научными организациями из зарегистрированных в установленном порядке фондов поддержки научной и (или) научно-технической деятельности. В течение последующих двух лет были приняты решения о сокращении до 1 года срока принятия к вычету расходов на НИОКР; отменено ограничение по списанию расходов на НИОКР, не давших положительного результата (ранее расходы на безрезультатные НИОКР не уменьшали базу по налогу на прибыль); увеличен до 1,5 % от выручки (в 3 раза) норматив расходов на НИОКР, осуществляемых в форме отчисления на формирование Российского фонда технологического развития и других отраслевых фондов; введен повышающий коэффициент, позволяющий учесть в расходах в 1,5 раза больше затрат на НИОКР, чем было ранее, что реально коснулось более, чем 120 направлений исследований. Полный и достаточно обширный перечень возможных расходов на НИОКР, принимаемых к расчету при формировании налоговой базы по налогу на прибыль, содержится в ст. 262 НК РФ.

Отдельный вопрос – создание резерва предстоящих расходов на НИОКР: целесообразность предоставления такой возможности в связи с высокими рисками организаций при проведении исследований неоднократно отмечалась в основных направлениях налоговой политики. В 2011 г. проблема была решена. В настоящее время налогоплательщики на основании разработанных и утвержденных планов проведения НИОКР могут самостоятельно принимать решение о создании резерва, отразив это в учетной политике для целей налогообложения. При этом расходы налогоплательщика, осуществляемые при реализации указанных программ, должны производиться за счет средств созданного резерва. В то же время, размер резерва ограничен и не может превышать величину, равную доходам от реализации отчетного (налогового) периода умноженную на коэффициент 0,03 за минусом отчислений на формирование фондов поддержки научной и инновационной деятельности, созданных в соответствии с ФЗ « О науке и государственной научно-технической политике», в сумме не более 1,5 % доходов от реализации. Существенная выгода налогоплательщика заключается в том, что средства резерва учитываются во внереализационных расходах, снижая тем самым налоговую базу текущего налогового периода. Это может стать действенным стимулом осуществления соответствующей деятельности.

Важным побудительным стимулом осуществления инновационных мероприятий является амортизационная политика, позволяющая при определенных обстоятельствах значительно быстрее накопить средства и снизить на некоторое время налоговые платежи за счет образования отложенных налоговых обязательств. Такой подход используется по многих странах и дает значительный инновационный эффект.