Функции воевод определялись особыми инструкциями или наказами. Они были разнообразны. Воеводы заведовали полицией, военным делом, обладали правом суда, иногда им поручалось (в пограничных уездах) ведать даже сношениями с иностранными государствами. Первоначально воеводы только наблюдали за деятельностью губных и земских органов. Но постепенно воеводы подчинили себе губные учреждения и сделали губных старост и целовальников своими помощниками. Им же были подчинены органы земского самоуправления в их полицейских функциях.

За исполнение своих обязанностей воеводы и их помощники получали жалованье. Воеводам запрещалось брать кормы с жителей, запрещалось заставлять жителей что-либо для себя делать. Соборное уложение 1649 г. запретило им вступать в обязательственные отношения с местными людьми. Однако злоупотреблений в этой сфере было довольно много, и некоторые воеводы ничем не отличались от кормленщиков. В 1642 г. этот вопрос был поднят на Земском соборе. В 1661 г. был издан указ, по которому на должности воевод должны были назначать только раненых и бывших в плену[304]. Кроме дьяков и подьячих воеводам были подчинены разного рода местные военные власти: стрелецкие, осадные, пушкарские, казацкие, засечные головы.

В правление Алексея Михайловича расширяются полномочия воевод, которые постепенно подменяют деятельность выборного местного самоуправления, сосредоточивая в своих руках всю финансовую и административную деятельность. Судебные полномочия тоже постепенно полностью переходят к воеводам и начинают осуществляться ими единолично. В результате складывается ситуация, при которой воеводы в практике своей деятельности заменяют всех должностных губных и земских выборных лиц: старост, целовальников, судных мужей и т. п.

Города в этот период не выделялись из уездов в качестве особых административных единиц. Органов городского самоуправления не существовало, за исключением некоторых городов. Так, в Новгороде городскими делами ведали пять старост, которые выбирались пятью концами города. Для решения наиболее важных дел, для контроля над деятельностью старост и для их выборов созывались сходы городских жителей, В Пскове ведала городскими делами коллегия из старост, выбиравшаяся и подотчетная сходу горожан. Однако с развитием городского хозяйства потребность в организации особого городского самоуправления возрастала.

Для обеспечения внешней безопасности и внутренней стабильности государства необходимо опираться на хорошо обученную и вооруженную по современным военным образцам армию. Дружинная организация войска не соответствовала потребностям государства, объединявшего огромную территорию и испытывающего постоянные военные угрозы со стороны соседей.

Со второй половины XV в. основной военной силой Московского княжества стали мелкие и средние феодалы: дети боярские, городовое и московское дворянство, составлявшие дворянское ополчение. Именно оно стало основой общерусского войска. Княжеские дружины и крупные военные отряды удельных князей и бояр постепенно сошли на нет, так как их наличие не отвечало требованиям централизации власти.

К несению службы в дворянские полки стали привлекаться все землевладельцы и служилые люди вотчин и поместий. Был запрещен отъезд служилых людей к другим князьям. Дворянское войско (ополчение, конница) основывалось на поместной системе, поэтому его еще называли поместным войском (ополчением или конницей). Поместья давались в условное владение за службу.

Комплектование войска происходило путем верстания, т. е. записи в полковые списки. Эти списки составлялись на смотрах всех служилых дворян и детей боярских, проводимых московскими чинами и местными воеводами. С момента занесения в списки начиналась обязательная военная служба дворянина, появлялось право на поместный оклад и денежное жалованье. На основании верстания перераспределялись земельные и денежные оклады. Дворянин, поступавший на военную службу, принимал присягу (крестоцеловальную запись), которая обязывала его верно служить государю.