Команчи состояли из нескольких (от 8 до 12) родственных, но абсолютно независимых племен, каждое из которых делилось на множество общин. Лишь наиболее крупные группы получали постоянное название. В конце XVIII века испанцы Новой Мексики выделяли три основные ветви – северную, южную и центральную. В 1860 году Р. Нейборс различал 8 племен; Д. Муни позже писал о 13, а Р. Лаум в 1913 году упомянул только четыре. Р. Томас, долго живший среди команчей в резервации, называл 20 племен, шесть из которых стояли на грани распада и вымирания. В целом же для второй половины XIX века можно выделить пять основных – пенатеки, котсотеки, нокони, ямпарики и квахади.
Пенатеки (или пенанде, пенатетка) – Поедатели Меда — были самым большим племенем команчей. Также известны под другими названиями: тейювит – Гостеприимные, текапвай – Нет Мяса, пенане – Осы, или Быстро Жалящие, хойс – Лесные Люди. Именно они первыми столкнулись с белыми. Согласно их преданиям, они двигались на юг так долго и зашли столь далеко, что утратили связь с прочими команчами, а о существовании ямпариков и квахади узнали лишь во время очередного набега в Мексику. Впоследствии пенатеки достаточно активно помогали армии США против сородичей, и память об этом до сих пор жива среди команчей.
Котсотеки (или кучетека, коцаи, кучанео, кучантика) – Поедатели Бизонов. Посетивший их в 1786 году эмиссар губернатора де Ансы Франсиско Хавьер Ортис сообщал, что на протяжении ста миль между реками Рио-Пекос и Ред-Ривер он обнаружил восемь селений, самое маленькое из которых состояло из 30 палаток, а всего их насчитывалось до 700. В каждой проживало три-четыре воина, а следовательно, всего котсотеков было 6000–7000. Эта информация любопытна, но сильно преувеличена.
Нокони – Те, Кто Поворачивается. Также известны как навьека – Часто Перемещающиеся, поскольку были вечными кочевниками, отличавшимися беспокойным характером даже среди команчей. После смерти вождя Нокони, имя которого носило это племя, из-за табу на имена умерших и по причине неряшливости своих стойбищ, оно получило название детсаноюка – Скитальцы, Ставящие Плохие Лагеря. В 1786 году губернатор Новой Мексики де Анса сообщал, что детсаноюки живут между реками Арканзас и Ред-Ривер и вместе со своими соседями тенава и танима составляют центральную ветвь команчей.
Ямпарики (илиямпарак, яппаретка) – Поедатели Ямпы, населяли северную часть Команчерии, как называли территорию команчей. Предполагается, что они позднее других команчей отделились от шошонов. Это подтверждается еще и тем, что шошоны штата Айдахо, сами называющие себя Нэм, всех команчей именуют именно ямпариками. Прежнее название ямпариков, измененное по тем же причинам, что и у нокони, – видъю (видьюнуу, видью-япа), или Шило.
Квахади (или квахари, квахарену, куахада) – Антилопы — были малоизвестны до конца дорезервационного периода. Имя свое получили, потому что жили на выжженных солнцем, богатых антилопами равнинах. Путешествуя по ним, они делали себе зонты из недубленой кожи, отчего получили прозвище квахихекену – Зонтики на Спинах. Их твердыней были равнины Льяно-Эстакад о, а от зимних вьюг они укрывались в глубоких каньонах Туле и Пало-Дуро. Квахади последними покорились американцам.