С 1897 г. институт стал базой Особой комиссии по предупреждению занесения в пределы России чумной заразы. В 1899 г. А.П. Ольденбургский получил разрешение использовать для «Особой лаборатории по заготовлению противочумных препаратов» форт «Император Александр I» около Кронштадта, который в институте прозвали «Чумной форт». Открытие лаборатории произошло в июле 1901 г.

С первых дней своей деятельности ИИЭМ завоевал международное признание. Престиж института был настолько высок, что все выходящие из его стен издания «не подлежали предварительной цензуре».

Начиная с 1920-х гг. ученые института участвовали в борьбе с инфекционными заболеваниями. В 1918–1931 гг. ГИЭМ расширил сферу научных исследований и стал ведущим учреждением страны в области теоретический биологии и медицины. В 1929–1939 гг. в его состав входила Биологическая станция в Колтушах, возглавляемая И.П. Павловым. В октябре 1931 г. для работы И.П. Павлова по изучению высшей нервной деятельности человека в институте создан отдел патофизиологии высшей нервной деятельности человека под руководством А.Д. Сперанского.

В годы Великой Отечественной войны многие сотрудники ушли на фронт. На территории института было развернуто два госпиталя.

С институтом экспериментальной медицины связаны имена ученых: биохимиков С.С. Салазкина и Б.И. Словцова, основоположников эволюционного направления в гистологии А.А. Заварзина и Н.Г. Хлопина, патоморфолога Н.Н. Аничкова, физиологов К.М. Быкова, П.С. Купалова, Л.А. Орбели, Д.Н. Насонова, микробиолога B. И. Иоффе.

В разное время в институте работали выдающиеся ученые: C. Н. Давиденков, Б.Л. Исаченко, А.А. Смородинцев, Г.М. Франк, В.Д. Цинзерлинг и многие другие.

Институт экспериментальной медицины является ведущим учреждением по проблемам высшей нервной деятельности и ее нейрофизиологических основ. С 1983 г. институт стал базовым учреждением Научного совета АН СССР и АМН СССР по физиологии человека.

Для удобства работников со стороны улицы Академика Павлова по проекту Н.Е. Лансере построили новую проходную. У входа в химический корпус по проекту Н.Е. Лансере и А.А. Рассадина соорудили фонтан-поилку для подопытных собак. Вода из пастей четырех змей – символа медицины – льется в гранитную чашу. К фонтану ведет аллея, по сторонам которой в 1935 г. по проекту архитектора И.Ф. Безпалова установлены бюсты Д.И. Менделеева, И.М. Сеченова, Л. Пастера, Ч. Дарвина. Скульптуры отлиты бронзолитейщиком К.И. Миглиником.

До строительства жилого дома для сотрудников ИЭМа на Каменноостровском проспекте многие из них жили на территории института. Среди них С.К. Дзержговский, А.А. Владимиров, А.А. Садов, Е.С. Лондон и многие другие. Здесь же жила скульптор Ю.Н. Свирская, произведения которой часто воспроизводились в периодической печати того времени.

В двухэтажном корпусе в саду ИЭМ находилось бюро по проектированию большого ВИЭМ. Руководителями бюро стали Б.К. Рерих и Н.Е. Лансере. В авторский коллектив входили: Б.Б. Малаховский, А.М. Соколов, В.И. Яковлев. Для изображения скульптур на проектах они иногда позировали друг другу на столах обнаженными. Чтобы кто-нибудь случайно не зашел, перед дверью ставили огромный шкаф, который надо было отодвинуть.

Фонтан-поилка

В 1909 г. на участке № 12, вплотную примыкающем к ИЭМ, по проекту Д.Г. Фомичева возведено здание «Русского общества беспроволочных телеграфов и телефонов» (РОБТиТ). Фасад здания украшает отделочная плитка. Нижние этажи облицованы гранитом.

«Русское общество беспроволочных телеграфов и телефонов» основано в октябре 1908 г. Инициаторами его учреждения стали инженер С.М. Айзенштейн и предприниматель Ю.М. Тищенко. Завод выпускал радиотехническую аппаратуру (радиостанции, радиопеленгаторы и т. д.), разрабатывая и проводя опыты по радиотелефонии. В 1917 г. на заводе работало 494 человека. На заводе под редакцией С.М. Айзенштейна выходил журнал «Вестник телеграфирования без проводов». К 1917 г. специалистами завода спроектировано, изготовлено и построено более половины мощных радиостанций в разных городах страны.