Цели, задачи, направления и основные пути развития государственной инновационной системы определены в «Основных направлениях политики Российской Федерации в области развития инновационной деятельности на период до 2010 года». Проводимая в настоящее время в России инновационная политика направлена на создание благоприятной экономической и правовой среды для инновационной деятельности, включая формирование инфраструктуры инновационной системы.

Эта политика также предусматривает меры государственной поддержки коммерциализации результатов интеллектуальной деятельности. Кроме того, существенное значение для активизации инновационной деятельности в России имеет принятый Федеральный закон «Об особых экономических зонах в Российской Федерации». В развитие этого закона в Российской Федерации уже созданы четыре особые экономические зоны технико-внедренческого типа – в Москве, Санкт-Петербурге, Дубне и Томске. Организационно-финансовое обеспечение деятельности этих зон возложено на созданное Федеральное агентство по управлению особыми экономическими зонами.