А тут еще возникла проблема с Черноморским флотом, который при приближении немцев увели из Севастополя в Новороссийск. Но теперь немцы угрожали оккупировать Кубань, если флот не вернется в Севастополь. Ленин считал, что лучше взорвать флот, чем отдать немцам. Но не было никакой уверенности, что морские офицеры выполнят такой приказ. Ленин и Троцкий решили показать флоту, что невыполнение приказа в боевых условиях будет караться предельно жестоко.

23 мая Щастный отправил по телеграфу Троцкому просьбу об отставке. Его вызвали в Москву. 27 мая в кабинете Троцкого в присутствии членов коллегии Наркомата по морским делам Щастный был арестован «по подозрению в проведении контрреволюционной агитации, неповиновении приказам советского правительства и намеренной дискредитации правительства в глазах моряков с целью его свержения». Щастного поместили в Таганскую тюрьму.

Его дело рассматривал революционный трибунал при ВЦИК.

Суд начался 20 июня в Кремле в зале здания Судебных установлений. Лев Троцкий, допрошенный как свидетель, предъявил Щастному обвинение в том, что тот готовил выступление против советской власти, рассказывая о том, что флот предан правительством в соответствии с секретным соглашением с немцами и что правительство делает все, чтобы уничтожить флот.

Обвинителем выступал Николай Крыленко. Он фактически просто повторил то, что сказал председатель Реввоенсовета. На следующий день был вынесен приговор: расстрел – за «подготовку контрреволюционного переворота и государственную измену».

Адвокатом Щастного был Владимир Жданов, который до 1917 года блистательно защищал социалистов-революционеров. Он был потрясен большевистским правосудием. За десять лет до этого процесса в тот же день и в том же зале он защищал молодого революционера Галкина, которому грозил смертный приговор. Но после речи адвоката обвиняемого приговорили к пожизненному заключению. Теперь Галкин как член революционного трибунала приговорил Щастного к смерти. Это был первый сметный приговор, вынесенный в Советской России. А ведь смертная казнь была отменена II Всероссийским съездом Советов.

На следующий день Щастного расстреляли во внутреннем дворе Александровского военного училища, где тогда находился наркомат Троцкого, а потом Министерство обороны…

В архиве ФСБ нашли его записку, написанную в девять вечера 21 июня 1918 года:

«Балтийскому флоту, которому с 1904 по 1918 год, в течение четырнадцати лет, я отдавал все свои силы:

а) в учебно-минном отряде;

б) на эскадре адмирала Эссена;

в) во время последней войны на боевых судах, который под натиском немцев благополучно ввел из Гельсингфорса в русские порты и который ни единого слова не сказал в защиту своего вождя, в лице его личного состава я посылаю ему свое проклятие.

Алексей Щастный».

Троцкий смело привлекал в Красную армию бывших офицеров, отдав им почти все высшие командные посты. Выступая на VIII съезде партии, он говорил, что надо шире привлекать людей из «старого командного состава, которые либо внутренне стали на точку зрения советской власти, либо силой вещей увидели себя вынужденными добросовестно служить ей».

В 1918 году в Красную армию добровольно вступили или были призваны двадцать две тысячи бывших офицеров. Троцкий, с одной стороны, требовал расстреливать комиссаров и командиров дивизий и полков, если у них офицеры перебегают к противнику (из-за этого у него в октябре 1918 года вышел конфликте командованием Восточного фронта, которое справедливо воспротивилось таким жестоким мерам), а с другой – предложил Ленину, Свердлову и Дзержинскому выпустить из тюрем офицеров, против которых нет серьезных обвинений, если они согласятся служить Красной армии.