Уже к полудню в город стали прибывать организованные вооруженные группы киргизов из близлежащих сел. Именно они явились организаторами и участниками многочисленных погромов, поджогов, грабежей и убийств.

Резню удалось остановить лишь к вечеру 6 июня, введя в область армейские части. Ценой огромных усилий армии и милиции удалось избежать вовлечения населения Узбекистана в конфликт на территории Киргизской ССР. Поход вооруженных узбеков из городов Наманган и Андижан в Ош был остановлен в нескольких десятках километрах от города. Толпа сметала милицейские кордоны и сжигала автомобили, зафиксированы случаи столкновений с армейскими подразделениями. Тогда перед рвущимися в Киргизию узбеками выступили главные политические и религиозные деятели Узбекской ССР, что помогло избежать дальнейших жертв.

Всего в ходе столкновений в Ошской области, по официальным данным, погибло около 300 человек. По неофициальной информации, жертв было гораздо больше – до 10 тысяч.

Вновь межэтнические столкновения между киргизами и узбеками вспыхнули в городе Ош 10–13 июня 2010 года, став серьезным испытанием для новой киргизской власти.

Давние противоречия между узбеками и киргизами в очередной раз обострились в результате образования политического вакуума, вызванного государственным переворотом 2005 года.

О причинах конфликта существует несколько мнений. Представители временного правительства считают, что за беспорядками стоит провокация сторонников свергнутого в ходе апрельского восстания 2010 года президента Курманбека Бакиева.

В то же время есть версия, что вспышка насилия носила криминальный характер и возникла после убийства Айбека Мирсидикова по прозвищу «Черный Айбек», который контролировал узбекскую диаспору в городе и был связан с наркотрафиком и «семьей Бакиева».

Есть и серьезные разночтения событий, ставших началом «второй ошской резни», как практически сразу, причем даже на официальном уровне, назвали произошедшее в те дни. В первую очередь, появились слухи об изнасиловании и убийстве узбеками нескольких студенток в общежитии Ошского госуниверситета. По другой версии, в ночь с 10 на 11 июня узбеки на дискотеке убили киргизов. По третьей – драка между узбеками и киргизами началась возле городской мечети.

Хронология событий, восстановленная по многим источникам, такова.

11.06.2010. Беспорядки вспыхнули вблизи гостиницы «Алай» и городского рынка. Одними из первых были подожжены Узбекский драматический театр, здание телекомпании «ОшТВ», два кафе: «Меркурий» и «Альфаи», торговый центр «Мукарам» (тут стоит заметить, что торговля в городе принадлежала бизнесменам-узбекам).

Для поддержания порядка в город были введены части правительственной армии при поддержке бронетехники и вертолетов. Впрочем, вскоре часть бронетранспортеров была захвачена восставшими и широко использовалась в ходе погромов.

Горящий Ош, июнь 2010. Фото с сайта http://doseng.org

Под охраной армии началась эвакуация приезжих женщин из студенческих общежитий. На домах появились многочисленные надписи на киргизском – «Озбектерге олум» («Смерть узбекам!») или «Алга Кыргызстан!» («Вперед, Кыргызстан!»), «Мекеним Кыргызстаным!» («Родина Кыргызстан!»). На въездах в город были установлены блок-посты, чтобы воспрепятствовать прибытию агрессивно настроенной молодежи из окрестных сел. В городе зафиксированы первые случаи мародерства.

В это же время в Бишкеке молодежь киргизской национальности начала захватывать микроавтобусы и машины, чтобы ехать на юг для участия в столкновениях с узбеками. Несколько десятков человек ворвались в здание Гостелерадиокомпании и потребовали предоставить им прямой эфир.