Второй этап в истории Греции (XI – IX века до н. э.) долгое время называли гомеровским. Такое название появилось вследствие устной традиции передачи знаний, преимущественно через творения Гесиода, Пиндара, Гомера. В сочинениях великих поэтов встречаются упоминания о болезнях и способах лечения ран, что наводит на мысль о светских, рациональных истоках греческой медицины. Эпосы Гомера содержат отдельные упоминания об анатомических знаниях того времени. Вскрытия трупов в Элладе не практиковались, но медицинская терминология «Илиады» и «Одиссеи» составила основу терминологии врачевателей позднего периода, сохранив актуальность до сегодняшнего дня.

Отличительной чертой эллинской культуры является большое внимание к личной гигиене, физическим упражнениям, закаливанию. Культ здорового, красивого тела отражен в скульптуре, в рисунках и орнаментах на вазах. Судя по изображениям, древние греки предпочитали постельному режиму обливание, растирание, массаж. В современной спортивной терминологии прижились такие понятия, как «стадион» (от греч. stadion – «место для состязаний»), «пентатлон» (от греч. pente – «пять» и athlon – «состязание», «пятиборье»). Приветствуя стремление к здоровому образу жизни, медики предостерегали соотечественников от чрезмерности даже в таком полезном занятии как физкультура. Великий медик древности невольно дал полезный совет современным женщинам, излишне озабоченным стройностью своей фигуры. «У предавшихся гимнастическим упражнениям, – сказано в „Афоризмах“ Гиппократа, – чрезвычайно хороший вид тела становится опасен, когда достигает крайних пределов, ибо он не может оставаться в том же состоянии и одновременно сохранять равновесие. Не имея возможности все улучшаться, он склоняется к худшему. Поэтому надо немедленно уменьшать – ослаблять этот хороший вид тела, чтобы оно опять получило первоначальную потребность питания. Но не следует доводить похудание до крайности, ибо оно опасно».

Не будучи медиком, Гомер описал 141 повреждение туловища и конечностей. Среди них поверхностные и проникающие ранения, ушибленные раны, нагноения как последствия укусов ядовитых змей. Их лечение состояло в удалении ранящих предметов с последующим выдавливанием крови и наложением повязок.

Войсковые лекари не отказывались от применения болеутоляющих и кровоостанавливающих растительных присыпок. Кроме того, в поэме рассказано о массовых заразных (чума) и психических заболеваниях (безумие товарищей Улисса, депрессия Беллерофона). В качестве лекарства войсковые лекари применяли серу, которая также была эффективным средством в предупреждении распространения инфекции.

Исторический этап, именуемый полисным периодом, связан с формированием на территории Греции городов-государств (полисов), объединявших свободных землевладельцев. Высокоразвитые общественные системы в Афинах, Коринфе, Спарте, Аргосе процветали с VIII по VI век до н. э. Этот период в истории греческой медицины характеризуется появлением натурфилософии, окончательно сложившейся в IV веке до н. э.

Второй отличительной чертой данной эпохи стало господство храмового врачевания, развившегося на основе народной медицины. Именно на этом этапе сложился культ Асклепия, господствовавший несколько веков в условиях отсутствия научно обоснованных медицинских школ. Однако семейные школы также имели место. Население Греции обслуживали врачи-периодевты. Вследствие переизбытка лекарей на родине они странствовали из одного города в другой с набором примитивных инструментов и лекарств. Периодевты практиковали не только среди земледельцев, конюхов и рабов. В источниках упоминаются имена знатных князей Алевадов, Дисериса, Сима, Гипполоха, не раз пользовавшихся услугами народных медиков. Хозяева дорожили своими людьми и врача могли пригласить для лечения раба или прислуги.