Успех Сагайдачному в его походах способствовал еще и благодаря внедрению им в Войске Запорожском строжайшей дисциплины, что позволило эффективно управлять всеми подразделениями в бою. Для этого он не останавливался перед самыми суровыми мерами – так, во время морских походов категорически запретил употреблять крепкие напитки, и нарушители могли заплатить жизнью за ослушание.

На следующий год Сагайдачный вновь осуществил удачный поход на Крымское ханство. Несмотря на то что турки знали о походе и заранее направили в Черное море военные корабли, они не смогли противостоять чайкам Сагайдачного и были разбиты под Очаковом. Запорожцами были взяты и сожжены Очаков и Перекоп, что еще более укрепило влияние и популярность кошевого атамана на Сечи.

Воинские способности кошевого атамана были оценены казаками и старшиной весьма высоко – в 1607 г. (это наиболее вероятная дата, хотя в исторической науке по этому вопросу нет единого мнения) он, с согласия запорожцев, провозглашает себя гетманом «обеих сторон Днепра и всего Войска Запорожского».

Уже в качестве гетмана Сагайдачный продолжает свои морские походы, что становились все более серьезной проблемой для Блистательной Порты.

В конце 1608 – начале 1609 г. под его командованием запорожцы на чайках дошли до Дуная, где успешно действовали на подступах к Килии, Белгороду и Измаилу. Особо отметим взятие Перекопа десантом запорожцев. Несмотря на яростное сопротивление гарнизона из янычар, десантная операция и штурм крепости были проведены гетманом безукоризненно.

В 1610 г. запорожцы под командованием Сагайдачного вновь атаковали эти сильные крепости, а также крепости Облучи и Новосидло.

Спустя два года гетман нанес сильные удары по османам с моря – крупными силами он провел штурм Гезлева, Бабадага, Варны и Месемврии. В конце этого же года гетман вместе с донскими казаками взял штурмом Гезлев.

На следующий год – очередной успех. Кроме уже ставших привычными победных походов на турецкое побережье, Сагайдачный разбил в устье Днепра специально высланную против запорожцев турецкую флотилию.

Весна 1614 г. принесла гетману первую серьезную неудачу. Идущие на Порту чайки попали в бурю, и многие из них утонули. Немногие чайки, оставшиеся после бури на плаву, были прибиты к анатолийскому побережью, где их и уничтожили турки. Однако эта неудача не остановила Сагайдачного, и он организует удачную десантную операцию против Трапезунда.

В итоге этот год все-таки принес гетману новый крупный успех – вновь вместе с донскими казаками он овладел крепостью Синоп и при этом уничтожил защищавший ее сильный флот.

Гнев султана от падения Синопа был настолько велик, что он приказал повесить за это великого визиря Наух-пашу, который был обвинен в поражении османов.

Отметим, что сотрудничество запорожцев и донцов не было ситуативным. Между ними был создан стратегический союз, окончательно оформившийся в следующем году, когда была достигнута договоренность совместно бороться против общих врагов. Запорожцы и донцы планировали в 1616 г. вместе идти на Азов, но вышло так, что их боевое содружество реализовалось в другом месте.

В 1615 г. запорожцы подошли к самому Константинополю и провели удачную десантную операцию между городскими портами Мизевной и Архиокой. Султан бросил на их преследование флотилию, но в устье Дуная турки потерпели полное поражение, а их командующий попал в плен.

Подлинно триумфальным стал для Сагайдачного 1616 г. Весной в устье Днепра он наголову разбил турецкую эскадру – только в качестве трофеев было захвачено 15 галер и несколько десятков мелких судов. После того как гетман ликвидировал опасность нападения с моря, вместе с донцами взял штурмом Каффу.