Уже через несколько дней пребывания Берии на Кавказе приказом командующего Закавказского фронта от 26 августа 1942 г. по согласованию и по инициативе наркома на базе укрепрайонов были образованы Владикавказский, Грозненский и Махачкалинский особые оборонительные районы[147]. Командиры дивизий войск НКВД одновременно являлись начальниками особых оборонительных районов, на них возлагалась вся полнота ответственности за подготовку к обороне. Армейские руководители, таким образом, попадали к ним в подчинение, что, естественно, многим не нравилось. Но Берия жёсткой рукой выстраивал под себя уникальную систему управления, которую, конечно же, не изучали в военных академиях.

Без приказа наркома внутренних дел запрещалось использовать дивизии войск НКВД в обороне и боевых порядках действующей армии на других участках фронта[148]. После занятия обороны войска НКВД, как повелось у пограничников, не имели права отступать без приказа. Согласно концепции Берии, наряду со штабом Закавказского фронта, осуществлявшим руководство обороной Северного Кавказа, эти же функции выполнял и созданный по требованию Лаврентия Павловича штаб НКВД.

Генерал армии Тюленев принял к неукоснительному исполнению «сконструированную» Берией систему управления войсками, хотя, несомненно, имел возможность её оспорить на уровне Генерального штаба и лично Сталина. В целях объединения усилий по обороне Северо-Кавказского региона был определён порядок взаимодействия частей Красной армии и войск НКВД. В директиве командующего Северной группы войск генерал-лейтенанта НКВД И.И. Масленникова от 23 августа 1942 г. определялись задачи обороняющимся частям по отражению агрессии врага в центральной части Северного Кавказа[149].

Для сооружения в короткие сроки мощных оборонительных укреплений вдоль рек Терек, Урух необходимо было в первую очередь установить прифронтовой порядок и пресечь действия диверсантов, бандгрупп, уклонистов от призыва в армию и дезертиров. В августе 1942 г. здесь действовало более 80 бандгрупп, 3 бандформирования, 12 диверсионных групп противника[150]. Неспокойней всего было в Северо-Кавказском регионе. Оперативно было проведено 43 специальных войсковых операции и ликвидировано 2345 бандитов[151], задержано 184 шпиона и диверсанта, 3004 дезертира и бандита, 9406 уклонившихся от оборонных работ и около 12 тыс. нарушителей прифронтового режима[152]. Только после наведения порядка стало возможным без опасения диверсий сооружение в кратчайшие сроки мощных оборонительных укреплений.

Для обеспечения безопасности в укрепрайонах устанавливалась круглосуточная пропускная система, в том числе на основных автомагистралях. В течение пяти дней из районов обороны были высланы все лица, состоявшие на оперучёте, выставлены контрольно-пропускные посты. Движение беженцев и отходящих армейских частей осуществлялось по специальным маршрутам[153].

Оперативными группами НКВД из прилегающих к этим дорогам селений были предусмотрительно эвакуированы старики, женщины и дети, а мужчины привлечены к оборонительным работам. Было взято на учёт 175 различных перевалов и горных проходов. На каждом из них были назначены старшие оперативные начальники из числа сотрудников госбезопасности и офицеров внутренних войск НКВД.

Огромное внимание уделялось специальной альпинистской подготовке. С 18 октября по 5 ноября 1942 г. был проведён сбор командиров по подготовке инструкторов-альпинистов в количестве 200 чел. Кроме этого, для обороны перевалов из состава ОМСБОН выделили группу спортсменов-альпинистов численностью 270 человек. Вскоре были подготовлены 6 групп подрывников общей численностью 500 человек, а также специальные отряды для действий в тылу фашистских войск. Кроме этого, в августе – сентябре 1942 г. инструкторы-альпинисты под руководством Т. Майсурадзе подготовили 12 альпийских горнострелковых отрядов численностью 3457 чел.