На юге Байкала начинается ударная комсомольская стройка будущего города Байкальска и Байкальского целлюлозно-бумажного комбината.
1959 При измерениях со льда тросовым лотом зафиксирована глубина озера – 1620 м.
1961 На базе Байкальской лимнологической станции создан Лимнологический институт СО АН СССР в пос. Листвянка.
1963 Первые подводные киносъемки о жизни байкальских организмов сделала студия «Киевнаучфильм».
1966 Ввод в эксплуатацию Байкальского целлюлозно-бумажного комбината.
1969–1975 гг. На промысловый лов омуля введен запрет с целью восстановления его общей биомассы. В это же время запрещается сплав древесины по впадающим в Байкал рекам и транспортировка его в плотах по Байкалу.
1974 Эхолотные промеры зафиксировали глубину озера 1637 м.
1986 Основаны Прибайкальский и Забайкальский национальные парки, Байкало-Ленский заповедник.
1990 По берегу Байкала проходит автопробег Camel Trophy Baikal-USSR'90 по маршруту: Братск – Зама – Еланцы – Листвянка. Его освещают свыше 300 иностранных журналистов.
1990 На мировые экраны выходит фильм о Байкале «Голубое око Сибири», снятый английскими кинодокументалистами при участии ЮНЕСКО.
1991 Осуществлено погружение на батискафе «Пайсис» на максимальную глубину Байкала – 1637 м.
1992 Создана постоянно действующая правительственная комиссия по Байкалу, координирующая деятельность по подготовке и реализации «Комплексной программы по обеспечению охраны и рационального использования природных ресурсов бассейна оз. Байкал».
1992 Первое бурение на Байкале в 7 км на юго-восток от устья Бугульдейки. Пробурено две скважины. Получен первый керн донных осадков длиной 120 м. Возраст осадков определен в 30 тыс. лет.
1993 На базе музея Лимнологического института создан Байкальский музей СО РАН.
1993 Издан научно-справочный атлас «Байкал» Российской академией наук по материалам многолетних исследований 1961–1985 гг.
1995 В Иркутске состоялась 1-я международная туристическая ярмарка «Байкал-тур-95», проведение которой в последующем стало ежегодным.
1996, 5 декабря. На ХХ сессии ЮНЕСКО, состоявшейся в мексиканском городе Мерида, озеро Байкал внесено в Список всемирного наследия ЮНЕСКО как природный объект.
1997, 26 августа. По инициативе активистов «Байкальской экологической волны» учрежден День Байкала. Его стали отмечать ежегодно в четвертое воскресенье августа.
1998 В районе Ушканьих островов произведено самое глубокое бурение на Байкале (600 м) с вмороженной в лед платформы. Изучение осадков подтвердило существование озера в течение последних 15 млн лет. Получен непрерывный осадочный 600-метровый керн, охватывающий временной интервал от 0 до 10,3 млн лет, позволяющий составить палеоклиматическую летопись.
1999 Учеными создана новая, более точная батиметрическая карта озера Байкал, подробно отражающая современные знания о морфологии озера и рельефе его дна.
1999 Принят Федеральный закон «Об охране озера Байкал».
2000 В результате действий природоохранных организаций и экологов на Байкале приостановлен проект глубинного бурения для поисков нефти.
2000, июнь. В рамках федеральной программы «Национальное наследие» возрождены Ёрдынские игры. Они состоялись около пос. Еланцы, в долине р. Анги, у подножия горы Ехе-Ёрд. Периодичность игр – один раз в четыре года.
2003, февраль. Состоялась первая «Зимниада» в Иркутске, организованная при содействии администрации Иркутской области для пропаганды зимних видов спорта на Байкале.
2006, апрель. В целях исключения рисков экосистеме озера Байкал, под давлением общественности, перенесен маршрут трассы нефтепровода Восточная Сибирь – Тихий океан за границы водосборного бассейна Байкала.