В целях оказания помощи командующим фронтами по указанию Сталина на Западный фронт были направлены маршалы Б.М. Шапошников и Г.И. Кулик, а на Юго-Западный фронт – генерал армии Жуков. Таким образом, Генштаб второй день войны встретил без своего начальника. Вся нагрузка теперь легла на Ватутина, который согласовывал свои действия с Жуковым.

В подвале здания Генштаба было оборудовано бомбоубежище, но оно оказалось совершенно неприспособленным для работы сотрудников Генштаба. Поэтому было решено на ночь перебираться в помещение станции метро «Белорусская», где на одной половине перрона были оборудованы командный пункт и узел связи. Другая половина перрона, отгороженная от первой только фанерной перегородкой, с наступлением сумерек заполнялась жителями Москвы, в основном женщинами и детьми. Работать в таких условиях было не совсем удобно, а самое главное – при ежедневных сборах и переездах терялось драгоценное время, нарушался рабочий ритм.

После 9 часов утра 22 июня в Кремль были вызваны И.А. Серов и заместитель начальника одного из отделов Управления НКВД Д.Н. Шадрин, которые получили от И.В. Сталина, Л.П. Берии и В.М. Молотова указание «подобрать такое место, где можно было бы укрыться от бомбежки и работать». К 16 часам было выбрано здание № 33 на улице Кирова с подземным туннелем, выходящим непосредственно на перрон станции метро «Кировская»[34]. После осмотра членами Политбюро (кроме Сталина) на перроне в течение четырех суток были оборудованы рабочие кабинеты, благо здесь накануне войны было создано резервное сооружение Генштаба. Новое помещение осмотрел Сталин[35]. Поезда здесь уже не останавливались. Перрон был отгорожен от путей высокой фанерной стеной. В одном его углу – узел связи, в другом – кабинет Сталина, рядом место для начальника Генштаба, а в середине – шеренги столиков для сотрудников Генштаба.

23 июня Сталин наконец-то принял предложение Тимошенко и Жукова о создании Ставки. Оно было оформлено протоколом № 34 Политбюро ЦК ВКП(б) в виде постановления СНК СССР и ЦК ВКП(б). В документе говорилось:

«Создать Ставку Главного Командования Вооруженных Сил Союза ССР в составе тт.: наркома обороны маршала Тимошенко (председатель), начальника Генштаба Жукова, Сталина, Молотова, маршала Ворошилова, маршала Буденного и наркома Военно-Морского Флота адмирала Кузнецова.

При Ставке организовать институт постоянных советников Ставки в составе тт.: маршала Кулика, маршала Шапошникова, Мерецкова, начальника Военно-Воздушных Сил Жигарева, Ватутина, начальника ПВО Воронова, Микояна, Кагановича, Берия, Вознесенского, Жданова, Маленкова, Мехлиса»[36].

Таким образом, юридически функциями Главнокомандующего был наделен нарком обороны. Однако без санкции Сталина он не имел права отдавать приказы действующей армии. Поэтому фактически Главнокомандующим был Сталин. Все это не только усложняло управление войсками, но и приводило к запоздалым решениям в быстро меняющейся обстановке на фронте.

Основным рабочим органом Ставки Главного командования (ГК) по стратегическому планированию и руководству вооруженной борьбой стал Генштаб. 24 июня на генерала Василевского и начальника Разведывательного управления генерала Голикова была возложена подготовка проектов правительственных сообщений о событиях на фронтах для Советского информационного бюро, созданного в соответствии с постановлением СНК СССР и ЦК ВКП(б). Кроме того, с конца июня Александру Михайловичу приходилось во исполнение приказаний наркома обороны, начальника Генштаба и его заместителей подписывать директивы Генштаба различного содержания.