Контрольные полномочия Счетной палаты распространяются на все государственные органы (в том числе их аппараты) и учреждения в РФ, на федеральные внебюджетные фонды.

Контрольные полномочия Счетной палаты распространяются также на органы местного самоуправления, предприятия, организации, банки, страховые компании и другие финансово-кредитные учреждения, их союзы, ассоциации и иные объединения вне зависимости от видов и форм собственности, если они получают, перечисляют, используют средства из федерального бюджета или используют федеральную собственность либо управляют ею, а также имеют предоставленные федеральным законодательством или федеральными органами государственной власти налоговые, таможенные и иные льготы и преимущества (ст. 12 Закона).

В число полномочий Счетной палаты входит проведение комплексных ревизий и тематических проверок по отдельным разделам и статьям федерального бюджета, бюджетов федеральных внебюджетных фондов, анализ и исследование нарушений и отклонений в бюджетном процессе, подготовка и внесение в Совет Федерации и Государственную Думу предложений по их устранению, а также по совершенствованию бюджетного законодательства в целом.

Для целей реализации норм Закона к субъектам отношений по формированию и инвестированию средств пенсионных накоплений отнесены Пенсионный фонд РФ, специализированные депозитарии и управляющие компании.

Ежегодному аудиту в Счетной палате РФ подлежат специализированные депозитарии и управляющие компании, в отношении которых Счетная палата РФ проверяет:

1) ведение бухгалтерского учета;

2) бухгалтерскую (финансовую) отчетность по формированию и инвестированию средств пенсионных накоплений;

3) финансирование выплат за счет средств пенсионных накоплений.

Постановлением Правительства РФ от 18 марта 2005 г. № 139[76] утверждены Правила проведения ежегодного аудита ведения бухгалтерского учета и финансовой (бухгалтерской) отчетности по формированию и инвестированию средств пенсионных накоплений, а также финансирования выплат средств пенсионных накоплений.

Целью проведения аудита является выражение мнения о соответствии порядка ведения специализированным депозитарием и управляющими компаниями, являющимися субъектами отношений по формированию и инвестированию средств пенсионных накоплений, бухгалтерского учета по формированию и инвестированию средств пенсионных накоплений и финансированию выплат за счет средств пенсионных накоплений требованиям законодательства РФ, а также о достоверности их финансовой (бухгалтерской) отчетности по формированию и инвестированию средств пенсионных накоплений и финансированию выплат за счет средств пенсионных накоплений.

Аудит проводится аудиторскими организациями в соответствии с Федеральным законом «Об аудиторской деятельности», Федеральными правилами (стандартами) аудиторской деятельности[77] и правилом (стандартом) аудиторской деятельности[78], на основании заключенных договоров оказания аудиторских услуг.

Заключение договоров оказания аудиторских услуг осуществляется в соответствии с Федеральным правилом (стандартом) № 12 «Согласование условий проведения аудита (утв. постановлением Правительства РФ от 23 сентября 2002 г. № 696 «Об утверждении Федеральных правил (стандартов) аудиторской деятельности»).

Аудит ведения бухгалтерского учета специализированным депозитарием и его финансовой (бухгалтерской) отчетности проводится раздельно в отношении операций по каждому договору об оказании услуг специализированного депозитария, заключенному с управляющими компаниями, осуществляющими доверительное управление средствами пенсионных накоплений, а также с Пенсионным фондом РФ.