В 1558 г. первый астраханский воевода И. Черемисинов перенес Астрахань на противоположный берег Волги. В 12 км ниже по течению он выбрал место, называемое Заячий, или Долгий, бугор, и решил тут строить крепость. Волга, ее приток Кутум, заболоченные протоки и соляное озеро надежно защищали новый город. В том же году на новом месте была построена крепость с земляными валами и деревянными стенами и башнями.

Москва придавала очень важное значение Астрахани, и в 1582 г. царь Федор Иоаннович повелел построить там каменную крепость с восемью башнями. Через 7 лет, в 1589 г., был построен кремль, но окончательные работы завершились лишь в 1619 г. Строилась крепость из кирпича и извести из развалин золотоордынской столицы Сарай-Бату (Селитренное городище), а также из производившихся на месте строительных материалов.

С приходом русских в районе Астрахани резко увеличилась добыча соли и рыбы. В этом деле большие льготы давались монастырям. Так, например, по жалованной грамоте Свияжскому Богородицкому монастырю от 25 мая 1584 г. монахам дозволялось иметь на Волге судно и ежегодно нагружать его в Астрахани десятью тысячами пудов соли или рыбы. Видимо, объем вывоза этих продуктов из города другими монастырями – казанским Зилантовым (Илантовым), суздальским Спасо-Евфимиевым, Троице-Сергиевым и другими – был не меньшим.

Морская торговля Астрахани с Персией и другими странами Каспийского бассейна продолжалась. Бусы, принадлежавшие русским и татарским купцам, ежегодно уходили из Астрахани на юг.

Каждый год в мае из Нижнего Новгорода в Астрахань выходил так называемый «весенний караван». В его составе были купцы, ехавшие в Астрахань и Персию, а также «государевы люди» и их семьи, отправлявшиеся на места новой службы. Часто к каравану присоединялись посольства, как русские, так и зарубежные. Караван шел под охраной стругов со стрельцами и пушками.

Суда шли большей частью самосплавом, но иногда употреблялись «гребки» (весла), а при попутном ветре ставились паруса. Для управления пользовались рулем. В наиболее же опасных местах, грозивших увлечь суда в быстрины или водовороты либо посадить их на мель (особенно на крутых поворотах), применяли рысковый якорь, который вывозился к берегу на длинном канате и сдерживал судно на нужной линии движения.

Путь из Нижнего Новгорода до Астрахани обыкновенно длился 30 дней, но случались и задержки еще на неделю или на две.

Подход каравана к Астрахани возвещался двумя пушечными выстрелами с командного судна. Заслышав выстрелы, толпы горожан высыпали на берег полюбоваться на красивое зрелище пристающего огромного каравана, на многих судах которого тотчас же открывалась торговля или начиналась выгрузка товаров на берег.

В конце июля из Астрахани отправлялся обратный караван, называемый «низовым», или «осенним», также в сопровождении стругов со стрельцами. Вверх по Волге суда шли на веслах и парусах, а в опасных местах или при очень быстром течении – и бечевой тягой, проходя за день в среднем не более 15–17 верст. Там, где нельзя было использовать бечевую тягу, практиковали тягу завозом якорей или «подачами», нанимая для этого артели рабочих, доходившие в середине XVII века до 100 и более человек. В этом случае караван проходил за день примерно 3 версты. В результате караван приходил в Нижний Новгород поздней осенью и обычно оставался там на зиму, а товары развозились по местам назначения на санях.

С разрешения русского правительства торговлей на Волге и Каспии решили заняться и англичане. В 1558 г. англичанин Дженкинсон купил в Астрахани бус, погрузил на него свои товары и отправился к полуострову Мангышлак. Там он перегрузил товары на верблюдов и добрался до Бухары. В следующем году он возвратился, а в 1562 г. приехал опять и на этот раз торговал в Персии. После этого англичане ходили через Каспийское море в 1564, 1565, 1568 и 1569 гг., пытаясь пробиться в Индию, но безуспешно.