В период с 1021 по 1080 г. Армения подверглась нашествию турок-сельджуков и противодействующих им византийцев. В конце концов туркам удалось ликвидировать армянскую государственность в так называемой Великой Армении.

Однако в 1080 г., с падением Великой Армении, государственная история армян переходит в историю Киликии. Государство это просуществовало около 300 лет. Киликия – часть Малой Армении – уже давно служила прибежищем армян, бежавших от преследований. Особенно увеличилось население Киликии после падения Великой Армении. Там возникает новое армянское государство, и в 1080 г. первым Киликийским царем был избран Рубен I, основатель новой династии Рубенидов. В царствование его сына Константина I (1095–1100) армяне участвовали в Первом крестовом походе, взяв на себя продовольственное снабжение. Константину также удалось расширить свои границы, освободив армянские города от греческого владычества.

Еще более расширил владения Киликии его сын Торос I (1100–1123). Умело лавируя между турками-сельджуками и греками, он вел удачную политику, направленную на укрепление своего государства. После его смерти престол перешел его брату Леону I (1123–1136). Леон продолжил политику брата, приобретя в борьбе с греками несколько городов и Антиохскую область. Эти действия вызвали гнев византийского императора Иоанна Комнина, который с большими силами вторгся в Киликию, захватил Леона и его сыновей и отправил в Константинополь. Там Леон умер в 1136 г., а его старший сын Рубен был ослеплен и убит. Младший же, Торос, прощен и даже принят на службу императора. Вскоре турки-сельджуки напали на Киликию. Иоанн Комнин с войсками двинулся им навстречу. В этом походе император умер, а Торос II вернулся в Киликию и 1141 г. занял трон своего отца.

Пользуясь войной Византии с турками, он объявил независимость Киликии. Вскоре новый император Мануил Комнин заключил с Торосом мир. В этот период ряд мелких мусульманских владений объединились под властью султана Нуреддина, захватившего город Эдессу в 1144 г. Это новое государство стало серьезной угрозой Киликии. Торос не замедлил принять участие в походе против Нуреддина в союзе с крестоносцами. Вернувшись из похода, Торос обнаружил, что греки, нарушив договор, опять захватили киликийские города. Он немедленно вернул их, разбив армию императора, а затем, снарядив корабли, сам напал на остров Кипр. Война с Византией продолжалась до конца царствования Тороса, то затухая, то возобновляясь с новой силой.

После смерти Тороса II трон занял его брат Мелек (1169–1174). Он вел удачные войны с греками, но за жестокость был убит собственными войсками в городе Сисе. После него киликийский престол перешел к Рубену II (1174–1177), сыну младшего брата, а затем к его брату Леону II (1177–1212). Новый царь прежде всего занялся внутренними делами страны: строительством городов, дорог, развитием торговли, ремесел, наук. Одновременно он был и прекрасным воином. Силой оружия он вернул Исаврию, захваченную турками. Он принял активное участие в Третьем крестовом походе (1189–1193).

Заключив договор с прибывшим в Малую Азию Фридрихом Барбароссой, он готов был присоединиться к крестоносцам, но внезапная смерть германского императора при переправе через реку Кидн изменили планы Леона. Прибывший же вскоре английский король Ричард Львиное Сердце нашел в Леоне готового союзника.

Такая близость с крестоносцами не могла не привлечь внимание католической церкви. Папа римский, понимая трудное положение Киликии, вынужденной постоянно сражаться, стал предлагать свое покровительство в обмен на слияние Армянской церкви с католической. Леон остался глух к этим предложениям. В это время пограничные споры с захваченной крестоносцами соседней Антиохией закончились миром и брачным союзом дочери Леона Алисии с Раймондом – сыном правителя Антиохии Боэмунда Тарентского. Но после смерти Раймонда, а затем Боэмунда разгорелись династические споры между Рубеном, сыном Алисии, и Рубеном Одноглазым, младшим сыном Боэмунда. В союзе с рыцарями ордена тамплиеров Рубен Одноглазый объявил войну Леону, поддержавшему права своего внука. Папа римский, встав на сторону противника Леона, отлучил киликийского царя от церкви. Но ничто не помогло. Леон быстро направился в Антиохию и отстоял права внука.