Второй царевич – Иван Иванович, родился 28 марта 1554 года, и его сберегли. Через два года родилась дочь Евдокия, умершая на третьем году, а 31 мая 1557 года родился болезненный Фёдор Иоаннович – последний царь из династии Рюриковичей. Утверждают, что здоровье царицы к тому времени было подорвано частыми родами, и сын-де родился слабоумным. Но роды по тем временам были не такими уж частыми – за десять лет шесть родов, а тогда рожали и из года в год. От рождения Анастасия не могла не быть здоровой – на хилых цари не женятся. Зато хилой её могли сделать, медленно отравляя. Вот тогда, надо полагать, и начались измены Ивана. Если они, конечно, начались.

Впрочем, вернёмся в первые годы реального правления Ивана IV Васильевича… К февралю 1549 года был подготовлен первый Земский собор – государственный орган, дотоле на Руси не существовавший. По сути, здесь можно говорить о переосмыслении идеи русского веча, поскольку Собор был органом во многом выборным и решал важнейшие вопросы не формально, а в обсуждении и размышлении. Это был совет царя с обществом. Впрочем, не исключено, что использовался и прецедент французских Генеральных Штатов, впервые созванных в 1302 году.

Уже создание Иваном нового сословно-представительного института – Земского собора, опровергает оценку его правления как тиранического. Тиранам советы не нужны. Иван же счёл необходимым для себя созвать и второй Земский собор – уже после введения опричнины, в 1566 году. Причём на этом втором Соборе в число его членов вошли не только бояре, дворяне, приказные и церковные иерархи, но и торгово-промышленные верхи.

Первый Земский собор 1549 года (эта датировка, впрочем, приблизительна) был точно назван «Собором примирения». На нём Иван в откровенной речи обрисовал мрачную картину внутреннего и внешнего положения России, обвинял бояр, каялся сам, просил сословия примириться и обещал быть впредь судьёй и защитой для народа.

Одним из важных результатов первого Собора стал вывод «детей боярских» – мелких феодалов, из-под юрисдикции их былых «кормленщиков» – крупной земельной знати. Теперь дворяне становились слугами государевыми, а не боярскими. Были намечены также пути государственной и судебной реформы, и в 1550 году Земским собором был принят Судебник Ивана IV. Этот Судебник вслед за Судебником 1497 года Ивана III стал выдающимся шагом на пути к централизации и укреплению Русского государства. Он ликвидировал судебные привилегии бывших удельных князей и усилил роль центральных судебных органов.

Была проведена реформа местного самоуправления: отменена система «кормлений» и введена система выборных земских властей. С 1555 года тяглые посадские люди и черносошные крестьяне стали выбирать земских старост («излюбленный голова»); отдельно избирались земские старосты в городах. В статье об Иване Грозном, помещённой в первом издании Большой Советской Энциклопедии, говорилось:

«Все тяжбы населения с кормленщиками были прекращены. Новый порядок местного самоуправления заменял прежнюю раздробленную феодальную администрацию централизованным аппаратом, подчинённым центральной власти. Средства, ранее распылявшиеся или оседавшие в карманах бояр-кормленщиков, теперь сосредоточивались в руках ответственных чиновников и притекали в Москву, обогащая царскую казну».

Была проведена и губная реформа, по которой все уголовные дела изымались из суда наместников с передачей в местные губные избы. Начало реформы относится к 1539 году, но завершило реформу правительство уже реально правящего Ивана IV. В результате губная изба – канцелярия губного старосты, где сосредоточивалось всё начальство (губной староста, его заместитель – губной целовальник, и губной дьяк-делопроизводитель), стала центром уездного управления. Все «губные» чины были выборными и подчинялись лишь Разбойному приказу. В 1555–1556 годах была составлена первая Уставная книга Разбойного приказа.