Уже к началу XVIII в. в Московском государстве законодательно была закреплена единая тарифная система пошлин. Следовательно, начинается более организованный сбор таможенных доходов, начинают быстрее развиваться торговые взаимоотношения.

Таможенные документы являются ценным историческим источником. Особенностью этих таможенных документов является то, что они помогают нам понять, как зарождалось таможенное дело, какие данные должны быть записаны в этих документах.

Исторические данные говорят нам, что канцелярские служители таможен сшивали таможенные документы в книги, которые были распределены по определенным тематикам.

Специальным указом от 6 марта 1689 г. таможенным головам «всех городов, и волостей, и сел» предписывалось строго различать товары в зависимости от их цены и соответственно этому вести раздельный сбор и учет таможенных пошлин. Пошлина с товаров «малоценных», т. е. ценой менее двадцати копеек, должна была записываться в специальную книгу мелочного сбора общей суммой, а для других товаров требовалось заносить в «записные таможенные книги» более подробные сведения: «что с кого, с каких товаров или с хлеба, с цены, с сколких четвертей, пошлин взято будет, […] всякую статью порознь». Кроме того, по запросам властей таможни выполняли справки различного характера – об уровне цен на какой-либо товар, о движении товаров и т. д., а также готовили разного рода отчетность.

Таможенные выписи являлись первичным документом таможенного оформления. Выписи содержали информацию о торговце и товаре, а также удостоверяли факт уплаты таможенной пошлины или ее части, если он имел место. Копия таможенной выписи выдавалась на руки торговцу.

Что представляла собой таможенная книга крупной внутренней таможни во времена Петра I, видно из описания таможенной книги Новгорода Великого за 1714 г., приводимого Б. Б. Кафенгаузом: «Эта обширная книга состоит из нескольких переплетенных вместе таможенных книг, с большой полнотой охватывающих новгородскую торговлю за целый год. В Новгородской таможне велись следующие записи: «товарная» книга служила для записи привоза основной массы разнообразных товаров; «хлебная» книга – для регистрации привоза и продажи хлеба; «весчая» книга – по отвесу меда, воска и хмеля. Кроме того, производилась запись отпуска товаров из Новгорода в другие города, запись мелочного сбора с торговли на площадях, регистрация «отъявочных» товаров, оставшихся непроданными на следующий год. Эти книги велись одновременно и позднее были переплетены вместе».

Сведения, которые записывались в таможенные выписки, имеют большое историческое значение, так как помогают понять историю развития таможенного дела и таможенной политики конкретного исторического периода, а также изучить вопросы истории развития ремесел и торговли разных районов страны и формирования всероссийского товарного рынка. Например, упоминания о явках ярославских торговых людей в таможенной книге Великого Новгорода 1610/11 г. Среди привезенных ими товаров называются «пятьдесят три сукна ярославских», «пятьдесят два кафтана сермяжных ярославских», «сорок девять косяков мыла ярославсково».

Различалась покупка на «явленные» деньги, объявляемые в таможне и предназначенные для торговых операций, и покупка на «товарные» деньги, вырученные от предыдущей продажи товаров. Рублевая пошлина в 5% полностью взималась с продавца, но ему могла быть предоставлена отсрочка в уплате пошлины до четырех недель с записью поручителей в таможенную книгу, и пошлина платилась в два приема. Запрещено было переводить пошлину на других лиц вместо себя, при отсрочке разрешалось оставлять в таможне залог в виде денег или товара, иногда даже оставлялись в заклад крепостные люди.