Выдающийся врач и мыслитель Древней Греции Гиппократ создал учение о причинах возникновения болезней и методах их лечения с использованием многочисленных растений. Он описал 236 растений, значение которых для гастроэнтерологии не потеряно и сегодня. Это бузина, ирис, золототысячник, миндаль, мята и др. Он считал, что лекарственные растения своим действием обязаны определенному, оптимальному сочетанию всех составных частей, и поэтому растения следует употреблять в том виде, в котором их создала природа, то есть в натуральном или в виде соков. Он писал: «Медицина есть искусство подражать целебному воздействию природы». Гиппократ часто пользовался, наряду с диетой, банками и ваннами, а диагноз ставил на основе наблюдений за больными. Этим самым он превратил медицинское «искусство» в науку.

Отцом европейской фармакогнозии считается греческий врач римской армии времен Нерона Диоскорид, который описал многие известные ему растения в сочинении Materia medica, послужившем в течение столетий настольной книгой врачей и фармацевтов. В своих книгах он описал около 6000 растений, дал их названия, рассказал о способах приготовления лекарств, их дозировке и воздействии.

По преданиям, на Кавказе (Колхида) под покровительством богини Артемиды находился волшебный сад ядовитых и лекарственных растений, откуда эти растения попали в Грецию.

Врач древности Клавдий Гален в противоположность Гиппократу считал, что часть действующих веществ растений оказывает лечебное действие, а другая – вредное. Для их разделения он предложил путем настаивания на вине, уксусе, воде отделять одни вещества от других. Извлечения из лекарственных растений завоевали популярность во всех странах Европы и сейчас широко используются, нося название «галеновых препаратов». Галеном был усовершенствован ряд лекарственных форм. В частности, появились так называемые териаки – противоядия от растительных и животных ядов. Если перевести значение этих фитокомпозиций, то Гален не только знал о ядовитых свойствах растений, но и разработал целую систему эндодетоксикации, применял средства лечения расстройств желудка и кишечника. Некоторые бальзамы включали до ста составных частей, среди которых преобладали растения, но были также и мед, змеиное мясо, рога и пр. Его учение просуществовало до XVIII века. Некоторые из бальзамов и сейчас введены в отечественную фармакопею и используются в качестве тонизирующих («Амрита», «Первопрестольный», «Кедровит», «Алтайский» и др.), желудочных («Бехеревка»), поливитаминных («Гербамарин», «Корфит» и др.) средств.

После Гиппократа Гален был последним великим представителем периода великолепного расцвета медицины в Европе. Период Средневековья в Европе отличался застоем в области медицинских знаний. Только в XI веке произошло некоторое оживление науки и постепенное вхождение ее в новую фазу развития. У колыбели культурной и научной мысли стояли духовные лица. В монастырских библиотеках сохранилось письменное наследие достижений античного мира, и это обстоятельство содействовало возникновению монастырской медицины. Монахам было поручено изучать труды Гиппократа, Диоскорида и Галена. Начался сбор сведений о народных лечебных средствах, постепенно возвращались к богатейшему опыту предшествующих поколений. В определенной мере этому способствовало широкое распространение эпидемий чумы и других тяжелых и нередко смертельных заболеваний.

Гениальный средневековый таджикский врач – энциклопедист Абу Али ибн Сина (980–1037) оставил для мировой цивилизации богатейшее наследие, охватывающее более двадцати отраслей науки, таких как философия, медицина, математика, литература и поэзия, педагогика, музыка, а также ряд других отраслей науки, свидетельствующих о необычайной широте его научных интересов.