Генерал Смит создал также и Управление национальных оценок (будущий Разведывательный директорат), призванный составлять аналитические обзоры по разведке в целом и по конкретным проблемам. Таким образом, структура ЦРУ начала приобретать современные очертания.

В этот период ЦРУ охватило своими тайными операциями весь земной шар. К 1953 г. крупные тайные операции (пропагандистские, полувоенные и политические) проводились в 48 странах. Оружие и денежные средства направлялись засевшим в Бирме недобитым гоминьдановцам (американцы надеялись, что им удастся превратить Бирму в плацдарм борьбы против социалистического Китая). В 1950 г. агенты ЦРУ помогли подавить народное восстание на Филиппинах, приведя к власти американского ставленника Рамона Магасасе.

В 1952 г. агенты ЦРУ свергли египетского короля Фарука и привели к власти бывшего агента Абвера и будущего Героя Советского Союза и любимца Хрущева Гамаля Абделя Насера. Впоследствии руководству ЦРУ пришлось сильно пожалеть об этом решении.

В 1953 г. эксперт ЦРУ по Ближнему Востоку Кермит Рузвельт организовал операцию по свержению иранского премьера Мохаммеда Мосаддыка и возвращению на трон шаха Мохаммеда Реза Пехлеви.

В 1954 г. ЦРУ провело полувоенную операцию по свержению президента Гватемалы Хакобо Арбенса, посягнувшего на самое святое – собственность американской компании «Юнайтед Фрут».

Велись тайные операции и непосредственно против главного противника – СССР. Начиная с августа 1949 г. была организована заброска на территорию СССР прошедших обучение в ЦРУ украинских и прибалтийских националистов. Агенты обеспечивались рациями и должны были держать связь со своими американскими руководителями, находившимися в Западной Германии. На протяжении пяти лет ЦРУ забрасывало своих агентов в СССР на парашютах или переправляло по Балтийскому морю, однако ни один из них так и не сообщил никакой информации, если не считать сигналов о провале.

В странах Восточной Европы создавались «группы сопротивления коммунизму». В рамках операции под кодовым названием «Красная шапка – красные носки» была организована спецподготовка польских, румынских, венгерских и чехословацких эмигрантов, которые должны были впоследствии возглавить «движения сопротивления» просоветским режимам в своих странах. На территории Западной Европы были размещены секретные склады оружия (чтобы в случае войны «освободительные» движения не остались с пустыми руками после прихода советской армии).

Американские военные самолеты постоянно вторгались в советское воздушное пространство. Вот лишь выдержка из списка потерь, официально признанных американцами:

8 апреля 1950 г. над Балтийским морем советскими истребителями был сбит самолет-разведчик ВМС США PB4Y-2 «Прайвэтир».

6 ноября 1951 г. вблизи советского побережья исчез патрульный самолет ВМС США P2V-3 «Нептун», обстрелянный перед этим советскими истребителями.

13 июня 1952 г. над Японским морем исчез совершавший разведывательный полет самолет ВВС США RB-29 «Суперфортрес».

7 октября 1952 г. вблизи японского побережья исчез самолет ВВС США RB-29A «Суперфортрес».

29 июля 1953 г. над Японским морем советскими истребителями сбит самолет ВВС США RB-50 «Суперфортрес».

4 сентября 1954 г. возле советского побережья сбит патрульный самолет ВМС США P2V-5 «Нептун».

7 ноября 1954 г. вблизи острова Хоккайдо (Япония) советскими истребителями сбит самолет-фоторазведчик ВВС США RB-29.

22 июня 1955 г. вблизи острова Св. Лаврентия в Беринговом море советскими истребителями сбит патрульный самолет ВМС США P2V-5 «Нептун».