19 ноября 1939 года приказом НКВД № 0390 была утверждена «Временная инструкция о войсковой охране лагерей военнопленных частями конвойных войск НКВД СССР».

7 октября 1939 года издается специальная Директива НКВД СССР 3 456/190 «Об агентурно-осведомительной работе среди военнопленных».

29 декабря 1939 года приказом НКВД № 0438 вводится в действие «Временная инструкция о работе пунктов НКВД по приему военнопленных».

Первые же лагеря для советских военнопленных были образованы после завершения неудачной советско-финской войны 1939–1940 гг.

Участник тех событий сержант В.К. Боярчук рассказывал:

«В марте 1940 года, когда было подписано перемирие, финны передали наших военнопленных – изможденных, обмороженных, инвалидов. По нашей стране их везли в санитарных поездах, к которым никого не подпускали. Ни один из моих знакомых домой не вернулся. Говорили, что большинство их находилось в Южском лагере Ивановской области. И почти все были осуждены. Некоторых приговорили к расстрелу…»

По данным исследователя этой трагедии Б.В. Соколова, в лагере находилось 4897 человек. В течение лета и осени 1940 года допросы закончились. И дела бывших военнопленных были тут же отправлены на Особое совещание в Москву. Оттуда через несколько недель для каждого прибывшего из финского плена пришли отдельные решения. Многих осудили к разным срокам лишения свободы, 232 военнослужащих были расстреляны по приговорам судов. Больных и инвалидов отпустили по домам.

28 декабря 1941 года выходит ПРИКАЗ НКВД № 001735 – «О создании специальных лагерей для бывших военнослужащих Красной Армии, находившихся в плену и в окружении противника».

Согласно приказу НКО СССР № 0521 для проверки военнослужащих Красной Армии, находившихся в плену или окружении противника, в конце 1941 года начали организовываться армейские сборно-пересыльные пункты из расчета один на армию.

9 февраля 1942 года выходит приказ НКВД № 00249 – «Об организации оперативного учета в Особых отделах НКВД спецлагерей».

По вполне понятным причинам с 11 января 1945 года (УПВИ) реорганизуется в Главное управление по делам военнопленных и интернированных (ГУПВИ) НКВД – МВД СССР.

С другой стороны на фоне крупных поражений вермахта на фронтах шла активизация со стороны спецслужб в направлениях разведывательной, диверсионной и террористической деятельности в тылах Красной Армии.

Из управлений фронтов в ГУКР СМЕРШ НКО СССР постоянно шла и шла информация о разоблаченной вражеской агентуре, задержанных диверсантах и террористах. Так постепенно перед руководством 2-го отдела и Главного управления четко проступала тайная паутина разведывательных школ и диверсионных курсов гитлеровской Германии. Паучьи гнезда с лихорадочным постоянством готовили и забрасывали разными путями тысячи оперившихся и легших на крыло птенцов – шпионов, диверсантов и террористов в наши тылы. У них были вполне определенные цели – разведка, организация диверсий и физического уничтожения командиров и политработников с замахом даже на жизнь (пример «майора» Таврина и его сподвижницы «младшего лейтенанта» Шиловой – 1944 год), Сталина и других руководителей Ставки ВГК страны.