Кто-то высказал мнение, что «хоббиты» острова Флорес страдали микроцефалией – патологией, при которой мозг развивается лишь до очень небольших размеров. Однако людям с генетическими заболеваниями, обусловливающими чрезмерно малые размеры тела и головного мозга, свойствен целый ряд черт, отсутствующих у «хоббита». Кроме того, такие больные редко достигают зрелого возраста. В то же время у «хоббитов» обнаруживается ряд архаичных особенностей, которые никогда не отмечались у больных микроцефалией.

В 2007 г. в журнале «Science» была опубликована обширная статья, посвященная результатам исследования костей запястья ископаемого «человека флоресского». Как оказалось, они имеют примитивное строение, практически неотличимое от запястья обезьяны. Ничего подобного ни у современного человека, ни у неандертальца не наблюдается. Трапециевидная кость «хоббита» по своему строению напоминает аналогичную часть скелета современных обезьян и более ранних видов ископаемого человека – австралопитека и Homo habilis. Следовательно, речь идет о представителе совершенно особого человеческого вида – боковой ветви возможных предков современного человека, отделившейся от основной линии развития человеческого рода еще до того, как сформировался общий предок современного человека и его близкого родственника неандертальца. По мнению профессора Майкла Морвуда, Homo floresiensis «представляет собой крайне архаичный подвид гоминид очень маленького роста и с очень маленьким объемом мозга. Представители этого подвида расселились из Африки еще до того, как возник наделенный рослым телом и большим мозгом Homo erectus».

Новым аргументом в пользу того, что загадочные «хоббиты» действительно являются представителями ранее неизвестного вида, стали результаты исследования строения черепной коробки и конечностей «хоббитов», опубликованные в мае 2009 г. На основе антропометрического анализа стопы «человека флоресского» профессор Уильям Юнгерс и его коллеги пришли к выводу, что наряду с параметрами, присущими современным людям, строение нижних конечностей «хоббитов» имеет архаические признаки, присущие австралопитекам или шимпанзе. Несмотря на способность к прямохождению, «хоббиты» ходили довольно неуклюже. Это были люди маленького роста, со скошенным подбородком и характерным для ранних австралопитеков основанием черепа и строением коренных зубов нижней челюсти. С другой стороны, толстый свод черепа, относительно плоское лицо и небольшие коренные зубы очень напоминают «человека прямоходящего». «Homo floresiensis, вероятно, является потомком человека прямоходящего Homo erectus, в ходе своего развития приобретшего островную карликовость и эволюционно деградировавшего, – заключает Юнгерс, – однако нельзя исключить, что этот вид является совершенно новым для науки, а строение его тела отражает набор характерных примитивных черт, доставшихся от предка, покинувшего Африканский континент намного раньше, чем мы считали до сих пор».

Но кем мог быть этот предок «хоббитов»? Логика подсказывала, что ближайшим кандидатом следует считать «человека яванского» (питекантропа). Эта одна из древнейших форм Homo erectus была обнаружена в конце XIX в. на острове Ява, входящем в тот же обширный архипелаг Зондских островов, что и Флорес. Однако, по мнению Майкла Морвуда, особенности строения скелета Homo floresiensis указывают на его близость не к «человеку яванскому», а… к гоминидам из Дманиси (Грузия). В 1991 г. в Дманиси были найдены ископаемые останки человека возрастом 1,75 млн лет, весьма напоминавшего африканского человека прямоходящего. В последующие десять лет в Дманиси были обнаружены окаменелые останки еще двух гоминидов, принадлежавших к виду Homo erectus.